グリセロール代謝ネットワークの構造同定のための混合整数ミニマックス動的最適化【JST・京大機械翻訳】

Wang Juan; Xu Honglei; Teo Kok Lay; Teo Kok Lay; Sun Jie; Ye Jianxiong

文献

J-GLOBAL ID：202002274559419522 整理番号：20A0767565

グリセロール代謝ネットワークの構造同定のための混合整数ミニマックス動的最適化【JST・京大機械翻訳】

Mixed-integer minimax dynamic optimization for structure identification of glycerol metabolic network

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資料名：
巻： 82 ページ： 503-520 発行年： 2020年
JST資料番号： H0624A ISSN： 0307-904X 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

細胞代謝は動的調節過程であり,そのネットワーク構造及び/又は調節機構は内部及び外部摂動により経時的に変化する。本論文では,時間変化代謝ネットワーク構造を整数値関数として定義することにより,非線形混合整数動的システムとして連続発酵におけるグリセロール代謝をモデル化した。動的ネットワーク構造と運動パラメータを同定するために,著者らはその目的関数として濃度ロバスト性を有する混合整数ミニマックス動的最適化問題を確立した。直接多重シューティング戦略と凸化,緩和および丸め戦略から成る分解アプローチにより,最適化問題を大規模近似多段階パラメータ最適化問題に変換した。次に,競合粒子群最適化アルゴリズムを用いて解いた。また,緩和問題は最適化問題に対して最良の下限を与え,その解は丸め戦略から得られた解により任意に近似できることを示した。数値結果は,提案した混合整数動的システムがグリセロールの連続発酵における細胞自己調節と中間代謝産物阻害に対する応答をより良く記述できることを示した。これらの数値結果は,提案した数値法が大規模混合整数動的最適化問題を解くのに有効であることを示した。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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数理計画法

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