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J-GLOBAL ID：202002275525428263   整理番号：20A0796859

中国における巨大サンショウウオからの多剤耐性分離株,低病原性Morgorgan morganii株CQ-M7のドラフトゲノム配列決定と注釈【JST・京大機械翻訳】

Draft genome sequencing and annotation of a low-virulence Morganella morganii strain CQ-M7, a multidrug-resistant isolate from the giant salamander in China

著者 (9件)： Zhao Guangwei (College of Animal Science, Southwest University, No. 160, Xueyuan Road, Chongqing, 402460, PR China) ,  Zhao Guangwei (Chongqing Sanjiezhongxin Bioengineering Co, Ltd, No.3 Southern Section of Yingbin Avenue, Chongqing, 402460, PR China) ,  Luo Zeli (College of Animal Science, Southwest University, No. 160, Xueyuan Road, Chongqing, 402460, PR China) ,  Wang Yan (Shanghai Customs, No.1208, Minsuring Road, Shanghai Pudong District, Shanghai, 200135, PR China) ,  Liu Jia (College of Animal Science, Southwest University, No. 160, Xueyuan Road, Chongqing, 402460, PR China) ,  Wu Di (College of Animal Science, Southwest University, No. 160, Xueyuan Road, Chongqing, 402460, PR China) ,  Zhang Liwu (Chongqing Sanjiezhongxin Bioengineering Co, Ltd, No.3 Southern Section of Yingbin Avenue, Chongqing, 402460, PR China) ,  Yang Xiaowei (College of Animal Science, Southwest University, No. 160, Xueyuan Road, Chongqing, 402460, PR China) ,  Yang Xiaowei (Chongqing Sanjiezhongxin Bioengineering Co, Ltd, No.3 Southern Section of Yingbin Avenue, Chongqing, 402460, PR China)
資料名： Journal of Global Antimicrobial Resistance  (Journal of Global Antimicrobial Resistance)
巻： 20  ページ： 248-252  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3403A  ISSN： 2213-7165  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 中国における病気の中国の巨大サラダの腎臓から分離された多剤耐性Morganella morganii株(CQ-M7)を,薬剤耐性とその病原性をより良く理解するために全ゲノム配列決定により調べた。研究された株のドラフトゲノムは,HGAアセンブラを用いて組み立てられ,Rapid Annotation Subsystem Technology(RAST)サーバを用いて注釈付けされた。バイオテクノロジー情報(NCBI)ウェブサイトのための国立センターで利用可能な適切なバイオインフォマティクスツールにより,コンティグを注釈した。抗生物質耐性遺伝子をPCRによって検出した。分離株の病原性は,異なる感染用量を有する30人の健康な中国の巨大なサンショウウオで行われた。CQ-M7株は,特にアミノグリコシドおよびβ-ラクタム抗生物質に対して複数の抗菌剤に対して耐性を示した。17の薬剤耐性遺伝子が検出され,β-ラクタム,アミノグリコシド,フルオロキノロン,テトラサイクリン,ペプチド抗生物質,ホスホマイシン耐性に関連した。配列分析は,4587の蛋白質コード遺伝子,71の偽遺伝子,5つのrRNA,80のtRNA,および5つの非コードRNAを含むGC含有量の51.16%を有する4966326bpであることを示した。ゲノム配列を受入番号RQIJ0000000の下でGenBankにおいて堆積した。人工感染の結果は,CQ-M7株が中国の巨大サンショウウオのための低い病原性株であることを示した。これは,中国における複数の抗生物質耐性遺伝子を持つ中国の巨大サンショウウオのオリジナルのMorganella morganii株の最初のドラフトゲノムであると信じられている。報告されたゲノム配列は,M.morganiiの抗生物質耐性機構と制御戦略に洞察を提供することができた。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： rRNA ,  tRNA ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  *ゲノム ,  *病原性 ,  ラクタム系抗生物質 ,  *多剤耐性 ,  ニューキノロン系抗細菌薬 ,  エノール ,  芳香族ケトン ,  フェノール類 ,  カルボアミド ,  エノン ,  芳香族縮合化合物 ,  アミノアルコール ,  ケト酸 ,  ジケトン ,  第三アミン ,  ヒドロキシ酸 ,  ヒドロキシケトン ,  ポリオール
準シソーラス用語： β-ラクタム ,  アミノグリコシド ,  バイオインフォマティクス ,  *ゲノム配列 ,  耐性遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 中国の巨大サンショウウオ ,  Morgorgan morganii ,  病原性 ,  耐性遺伝子 ,  全ゲノム配列決定

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物感染の生理と病原性  (EG03053T)

物質索引 (1件)： テトラサイクリン

タイトルに関連する用語 (9件)： 中国 ,  サンショウウオ ,  多剤耐性 ,  分離株 ,  病原性 ,  株 ,  ドラフト ,  ゲノム配列 ,  注釈