抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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目的:大腸菌における細胞分裂抑制因子(SdiA)の潜在的制御遺伝子をスクリーニングした。方法:大腸菌E.coliSM10λpir野生株、E.coliSM10λpirSdiAノックアウト株、E.N-アシル-L-ホモセリンラクトン(AHLs)のシグナル分子を,AHLs処理グループとして,SdiA過剰発現回復株に,それぞれ,N-アシル-L-ホモセリンラクトン(AHLs)で処理した。3つの菌株を,それぞれ等量のDMSOで処理し,非AHLs処理群とした。2つのグループの遺伝子転写グループを配列した後、R言語edgeRソフトウェアパッケージにより差次的発現遺伝子を選別した。2群のE.coliSM10λpirSdiAノックアウト株とE.coliSM10λpir野生株間、E.coliSM10λpirSdiA過剰発現回復株とE.SM10λpirSdiAノックアウト株の間に,AHLsシグナル分子がない場合,SdiAの潜在的な調節遺伝子があり,群間比較を行った。AHLsシグナル分子がない時、SdiAの潜在的な調節遺伝子の変化を観察した。結果:非AHLs処理グループにおいて,E.coliSM10λpirSdiAノックアウト株とE.coliSM10λpir野生株間,E.coliSM10λpirSdiA過剰発現回復株とE.SM10λpirSdiAノックアウト株間の差異的発現の遺伝子は,narH,narJ,narI,yeeE,yeeR,paaE,flu.AHLs処理グループで,E.大腸菌SM10λpirSdiAノックアウト株とE.coliSM10λpir野生株間、E.coliSM10λpirSdiA過剰発現回復株とE.SM10λpirSdiAノックアウト株の間で,hcp,yt-fE,hcr,hmp,narH,narJ,narl,yeeE,yeeR,flu,ydiV,hdhA.narH,およびhdhA.narHが同時に発現された。narJ、narI、yeeE、yeeR、flu遺伝子は両組においてSdiAの潜在的な制御遺伝子であり、hcp、ytfE、hcr、hmp、ydiV、hdhA遺伝子はAHLs信号分子が存在する時のみSdiAの潜在的な制御遺伝子である。【結論】大腸菌において,SdiAの潜在的な調節遺伝子は,narH,narJ,narI,yeeE,yeeR,flu,paaE,hcp,ytfE,hcr,hmp,ydiV,hdhAであり,hcp,ytfE,およびhdhAに含まれていた。hcr、hmp、ydiV、hdhA遺伝子の制御はAHLsシグナル分子に依存する。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】
