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J-GLOBAL ID：202002276029237710   整理番号：20A0134473

ArabidopsisとイネにおけるSabath遺伝子ファミリーのゲノムワイド包括的解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Comprehensive Analysis of the SABATH Gene Family in Arabidopsis and Rice

著者 (5件)： Wang Bin (College of Chemistry, Biology and Materials Science, East China University of Technology, Nanchang, P.R. China) ,  Wang Bin (National Engineering Laboratory for Resource Development of Endangered Crude Drugs in Northwest China, Key Laboratory of the Ministry of Education for Medicinal Resources and Natural Pharmaceutical Chemistry, College of Life Sciences, Shaanxi Normal University, Xi’an, P.R. China) ,  Li Min (College of Chemistry, Biology and Materials Science, East China University of Technology, Nanchang, P.R. China) ,  Yuan Yijun (College of Chemistry, Biology and Materials Science, East China University of Technology, Nanchang, P.R. China) ,  Liu Shaofang (College of Chemistry, Biology and Materials Science, East China University of Technology, Nanchang, P.R. China)
資料名： Evolutionary Bioinformatics  (Evolutionary Bioinformatics)
巻： 15  ページ： 1176934319860864  発行年： 2019年 
JST資料番号： W5210A  ISSN： 1176-9343  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 低分子量代謝産物は重要な植物ホルモンとシグナル伝達分子であり,植物発生の過程の間で重要な役割を果たす。それらの活性はSABATHにより行われるメチル化の化学修飾により影響される可能性がある。本研究では,Arabidopsisおよびイネにおける合計24および21のSABATH遺伝子を同定し,包括的研究を行った。系統発生分析は,AtSABATHとOsSABATH遺伝子が4つの主要なグループと6つのサブグループに分類できることを示した。遺伝子拡大分析は,ArabidopsisとイネにおけるSABATH遺伝子ファミリーの主要な拡大機構が,タンデム重複とセグメント重複であることを示した。AtSABATHとOsSABATH遺伝子の非同義(Ka)と同義(Ks)置換率の比率は,ArabidopsisとイネにおけるSABATH遺伝子ファミリーが精製選択を通していることを示した。部位モデルと分岐部位モデルによる陽性選択分析は,AtSABATHとOsSABATH遺伝子が適応進化のために選択的圧力を受けたことを明らかにした。モチーフ分析により,ある種のモチーフのみが特異的なサブグループまたは種に存在することを示し,ArabidopsisおよびイネのSABATH蛋白質が異なる種およびサブグループにおいて多様性を示すことを示した。機能的相違分析により,AtSABATHとOsSABATHサブグループ遺伝子は機能的差異を有し,サブグループ間の機能的相違に寄与する陽性選択部位が検出されたことを示唆した。これらの結果は,SABATH遺伝子ファミリーの機能的保存と多様化への洞察を提供し,SABATH遺伝子ファミリー機能をさらに解明するための有用な情報である。Copyright The Author(s) 2019 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 系統発生 ,  置換率 ,  多様化 ,  低分子量 ,  代謝産物 ,  遺伝子重複 ,  直列接続 ,  メチル化 ,  *Arabidopsis ,  植物ホルモン ,  *遺伝子
準シソーラス用語： 適応進化 ,  系統解析 ,  *遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Sabath遺伝子ファミリー ,  系統発生解析 ,  遺伝子重複 ,  保存モチーフ ,  非同義および同義置換率 ,  正の選択 ,  機能的発散

分類 (2件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： Arabidopsis ,  イネ ,  遺伝子ファミリー ,  ゲノム ,  解析