抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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目的:山豆根による白血病治療の潜在的作用機序を検討する。方法;漢方薬システム薬理学分析プラットフォームデータベースを用いて、山豆根活性成分及びその対応標的タンパク質を検索し、UniProt、PubMedデータベースを用いて、活性成分の標的タンパク質に対応する遺伝子名称を検索し、Cytoscape3.6を用いた。ソフトウェアは,化合物-ターゲットネットワークを構築する。DisGeNETデータベースにより白血病に関連する遺伝子(すなわち疾病標的)を検索し、OmicShareプラットフォームを用いて、ヤツキの根活性成分の標的と白血病の疾病の標的との交雑遺伝子を選別し、STRINGデータベースとCytoscape3.6を利用した。蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークをソフトウェアによって構築し,トポロジー解析を実行した。DA-VIDバイオインフォマティクスデータベースを用いて、遺伝子オントロジー(GO)分析とKEGG経路濃縮分析を行った。結果;13の根活性成分と204の標的蛋白質を得て,そして,前記の化合物と標的蛋白質は,クエルセチン,ケンペロール,プロスタグランジンエンドペルオキシドシンターゼ2(PTGS2),蛋白質セリンプロテアーゼ1(PRSS1),および蛋白質を含む。カルモジュリン依存性プロテインキナーゼ(CAMKK2)など。山豆根活性成分の標的と白血病の疾病の標的との交雑遺伝子は共に24個で、IRF1、BCL2、CYP1A1、PIM1などを含む。上記交雑遺伝子のPPIネットワークは、ノード24個、辺142本を含み、平均ノード度値は6.5で、平均メジアン数は0.045.GO分析結果により、上述の交集遺伝子の生物過程はリガンドの体外アポトーシスシグナル経路、アポトーシス過程の負の制御と関係があることが分かった。B細胞増殖の正の調節など、分子機能は主にタンパク質同源化活性、同じタンパク質の結合などを含み、細胞成分は主に細胞外領域、ミトコンドリアなどを含む。KEGG経路濃縮分析結果により、上述の交雑遺伝子は主にT細胞受容体シグナル伝達経路、Janusキナーゼ/シグナル伝達及び転写活性化因子(JAK/STAT)シグナル伝達経路、ヒトTリンパ球I型ウイルス(HTLV-I)感染などの経路と関係があることが分かった。結論:山豆根中の活性成分はJAK/STAT信号経路、HTLV-I感染などの経路を通じてPTGS2、PRSS1、CAMKK2などの標的に作用し、さらに白血病に対する治療作用を発揮し、多成分、多標的、多経路の特徴を呈する。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】