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J-GLOBAL ID：202002276283321184   整理番号：20A0975764

In-depthプロテオミクス解析による細胞株におけるAlkB7のインタラクトームおよびプロテオミクス応答【JST・京大機械翻訳】

The interactome and proteomic responses of ALKBH7 in cell lines by in-depth proteomics analysis

著者 (8件)： Meng Shu (State Key Laboratory of Medical Molecular Biology & Department of Immunology, Institute of Basic Medical Sciences Chinese Academy of Medical Sciences, School of Basic Medicine Peking Union Medical College, Beijing, China) ,  Zhan Shaohua (State Key Laboratory of Medical Molecular Biology & Department of Immunology, Institute of Basic Medical Sciences Chinese Academy of Medical Sciences, School of Basic Medicine Peking Union Medical College, Beijing, China) ,  Zhan Shaohua (National Center for Clinical Laboratories, Beijing Hospital, National Center of Gerontology, Institute of Geriatric Medicine, Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing, People’s Republic of China) ,  Zhan Shaohua (Graduate School, Peking Union Medical College, Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing, People’s Republic of China) ,  Dou Wanchen (Department of Neurosurgery, Peking Union Medical College Hospital, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing, China) ,  Ge Wei (State Key Laboratory of Medical Molecular Biology & Department of Immunology, Institute of Basic Medical Sciences Chinese Academy of Medical Sciences, School of Basic Medicine Peking Union Medical College, Beijing, China) ,  Ge Wei (Department of Neurosurgery, Affiliated Hospital of Hebei University, Baoding, China) ,  Ge Wei (State Key Laboratory of Medical Molecular Biology & Department of Immunology, Institute of Basic Medical Sciences Chinese Academy of Medical Sciences, School of Basic Medicine Peking Union Medical College, Beijing, China)
資料名： Proteome Science (Web)  (Proteome Science (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 1-10  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7393A  ISSN： 1477-5956  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ALKBH7は,プログラム壊死,脂肪酸代謝,細胞周期調節および前立腺癌疾患に関与するミトコンドリア蛋白質である。しかしながら,ALKBH7の正確な役割と基礎となる分子機構は,謎のままである。したがって,プロテオミクス戦略を用いた細胞系におけるALKBH7の相互作用とプロテオミクス応答の研究が緊急に必要である。本研究では,免疫沈降質量分析/質量分析(IP-MS/MS)により,ミトコンドリアにおけるALKBH7の相互作用を調べた。さらに,ALKBH7ノックダウンと過剰発現細胞系を確立し,さらに,これらの細胞系における特異的発現蛋白質(DEPs)を,TMTに基づくMS/MSにより同定した。2つのDEPs(UQCRHとHMGN1)を,ウエスタンブロット法分析によって検証した。バイオインフォマティクス解析により,ALKBH7が蛋白質ホメオスタシスと細胞免疫に関与し,PTMA,PTMS,UQCRH,HMGN1,およびHMGN2の発現を調節することにより,細胞増殖,脂質代謝,およびプログラム壊死が関与することを見出した。ALKBH7のノックダウンはUQCRHとHMGN1発現のアップレギュレーションをもたらし,発現の逆のパターンはALKBH7過剰発現細胞系で検出された;これらの結果は著者らのプロテオミクスデータと一致した。著者らの知見は,UQCRHとHMGN1の発現がALKBH7によって制御され,ALKBH7の将来の研究のための潜在的方向を提供することを示す。さらに,著者らの結果はまた,ALKBH7に関連する分子機構と経路への包括的洞察を提供する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 質量分析 ,  相互作用 ,  壊死 ,  タンパク質 ,  ミトコンドリア ,  細胞増殖 ,  ホメオスタシス ,  免疫沈降反応 ,  前立腺腫瘍 ,  アップレギュレーション ,  ウェスタンブロット法 ,  *プロテオミクス
準シソーラス用語： 遺伝子ノックダウン法 ,  *インタラクトーム ,  過剰発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： AlKBH7 ,  MS/MS ,  プログラム化壊死 ,  脂質代謝

分類 (4件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  細胞生理一般  (EF02010S) ,  抗腫よう薬の基礎研究  (GW16010A) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (34件)：

• Mol Cell; The DNA damage response: making it safe to play with knives; A Ciccia, SJ Elledge; 40; 2; 2010; 179-204; 10.1016/j.molcel.2010.09.019; citation_id=CR1
• Acta Biochim Pol; Bacterial DNA repair genes and their eukaryotic homologues: 3. AlkB dioxygenase and Ada methyltransferase in the direct repair of alkylated DNA; J Nieminuszczy, E Grzesiuk; 54; 3; 2007; 459-468; 10.18388/abp.2007_3221; citation_id=CR2
• Science (New York, N.Y.); The obesity-associated FTO gene encodes a 2-oxoglutarate-dependent nucleic acid demethylase; T Gerken, CA Girard, YC Tung, CJ Webby, V Saudek, KS Hewitson, GS Yeo, MA McDonough, S Cunliffe, LA McNeill, J Galvanovskis, P Rorsman, P Robins, X Prieur, AP Coll, M Ma, Z Jovanovic, IS Farooqi, B Sedgwick, I Barroso, T Lindahl, CP Ponting, FM Ashcroft, S O'Rahilly, CJ Schofield; 318; 5855; 2007; 1469-1472; 10.1126/science.1151710; citation_id=CR3
• Nucleic Acids Res; Repair of 3-methylthymine and 1-methylguanine lesions by bacterial and human AlkB proteins; PO Falnes; 32; 21; 2004; 6260-6267; 10.1093/nar/gkh964; citation_id=CR4
• J Biol Chem; Human AlkB homolog 1 is a mitochondrial protein that demethylates 3-methylcytosine in DNA and RNA; MP Westbye, E Feyzi, PA Aas, CB Vagbo, VA Talstad, B Kavli, L Hagen, O Sundheim, M Akbari, NB Liabakk, G Slupphaug, M Otterlei, HE Krokan; 283; 36; 2008; 25046-25056; 10.1074/jbc.M803776200; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (6件)： DEPTh ,  プロテオミクス解析 ,  細胞株 ,  インタラクトーム ,  プロテオミクス ,  応答