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J-GLOBAL ID：202002276677144657   整理番号：20A0952606

MapReduceに基づく生物学的配列決定の品質評価のための分散アルゴリズム【JST・京大機械翻訳】

A Ditributed Algorithm for Quality Assessment of Biological Sequencing Based on MapReduce

著者 (4件)： Yang Jie (Southwest Forestry University,College of Big Data and Intelligent Engineering,Kunming,China) ,  Cao Yong (Southwest Forestry University,College of Big Data and Intelligent Engineering,Kunming,China) ,  Huang Biao-sheng (Southwest Forestry University,College of Big Data and Intelligent Engineering,Kunming,China) ,  Zhao You-jie (Southwest Forestry University,College of Big Data and Intelligent Engineering,Kunming,China)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2019  号： ICCC  ページ： 188-192  発行年： 2019年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNA配列決定技術は生命科学,特にIllinaのsequサーに重要な役割を果たしている。それは,より多くの生物学的ゲノムとトランスクリプトームプロジェクトのために使用された。大量の生物学的配列データに直面して,それはその品質を迅速に評価する問題である。本論文において,著者らはMapReduceに基づく分散アルゴリズムを開発して,それは並列における生物学的配列の品質を評価することができた。アルゴリズムを検証するために,異なるデータサイズ(1G-20g)を用いて,Hadoopプラットフォームにおける異なる計算ノード(1-20)によってテストした。結果は,並列効率がデータサイズと計算ノードの増加に従って連続的に改善することを示した。そして,データサイズと計算ノードが5Gbと10プロセッサより大きいとき,アルゴリズムにはより良い並列効率がある。本研究は,生物学的配列決定の品質評価の時間を効果的に節約する。Copyright 2020 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *アルゴリズム ,  ゲノム ,  演算プロセッサ ,  ライフサイエンス ,  *分散アルゴリズム ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *品質評価 ,  DNA配列 ,  Hadoop ,  *MapReduce ,  データサイズ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 図形・画像処理一般  (JE04010I)

タイトルに関連する用語 (4件)： MapReduce ,  生物学 ,  品質評価 ,  分散アルゴリズム