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J-GLOBAL ID：202002277150246300   整理番号：20A1015744

HIV Nef媒介CD4,HLAおよびSERINC5ダウンレギュレーション活性の長期的な宿主内進化:事例研究【JST・京大機械翻訳】

Longitudinal within-host evolution of HIV Nef-mediated CD4, HLA and SERINC5 downregulation activity: a case study

著者 (15件)： Sudderuddin Hanwei (Faculty of Health Sciences, Simon Fraser University, Burnaby, Canada) ,  Sudderuddin Hanwei (BC Centre for Excellence in HIV/AIDS, Vancouver, Canada) ,  Kinloch Natalie N. (Faculty of Health Sciences, Simon Fraser University, Burnaby, Canada) ,  Kinloch Natalie N. (BC Centre for Excellence in HIV/AIDS, Vancouver, Canada) ,  Jin Steven W. (Faculty of Health Sciences, Simon Fraser University, Burnaby, Canada) ,  Miller Rachel L. (Faculty of Health Sciences, Simon Fraser University, Burnaby, Canada) ,  Jones Bradley R. (BC Centre for Excellence in HIV/AIDS, Vancouver, Canada) ,  Brumme Chanson J. (BC Centre for Excellence in HIV/AIDS, Vancouver, Canada) ,  Brumme Chanson J. (Department of Medicine, University of British Columbia, Vancouver, Canada) ,  Joy Jeffrey B. (BC Centre for Excellence in HIV/AIDS, Vancouver, Canada) ,  Joy Jeffrey B. (Department of Medicine, University of British Columbia, Vancouver, Canada) ,  Brockman Mark A. (Faculty of Health Sciences, Simon Fraser University, Burnaby, Canada) ,  Brockman Mark A. (BC Centre for Excellence in HIV/AIDS, Vancouver, Canada) ,  Brumme Zabrina L. (Faculty of Health Sciences, Simon Fraser University, Burnaby, Canada) ,  Brumme Zabrina L. (BC Centre for Excellence in HIV/AIDS, Vancouver, Canada)
資料名： Retrovirology (Web)  (Retrovirology (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 1-10  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7344A  ISSN： 1742-4690  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： HIVアクセサリー蛋白質Nefは,ウイルス侵入受容体CD4,ヒト白血球抗原(HLA)-Aおよび-B分子,セリン受容体5(SERINC5)蛋白質および感染細胞表面からの他の分子を下方制御し,ウイルス感染性,複製および免疫回避を促進する。nef遺伝子座はHIVゲノムにおける最も遺伝的に変動する領域の1つであり,nef配列は感染過程にわたって単一個体内で実質的進化を受ける。しかし,長時間スケールにわたるNef蛋白質機能に及ぼす宿主内nef配列進化の影響を同時に特性化した研究はほとんどない。ここでは,この期間中に抗レトロウイルス治療に大きくナイーブな個人の血漿から11年間にわたり単一ゲノム増幅により50のユニークなNefクローンを分離した。これらのクローンは,nefのコドンの13%で非同義置換を有していた。細胞表面CD4,HLAおよびSERENC5をダウンレギュレーションする能力を評価し,3つのNef機能が時間とともに低下し,CD4およびHLAダウンレギュレーションの減少(それぞれ平均0.6%および2.0%)が統計的有意性を達成することを観察した。この事例研究の結果は,未処理のHIV感染を通して維持するのに重要な3つのNef活性を支持するが,nefの変異可塑性にもかかわらず,宿主内ウイルス進化はNef機能を損なうことができる。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 塑性 ,  血漿 ,  遺伝 ,  ウイルス感染 ,  コドン ,  タンパク質 ,  ゲノム ,  レトロウイルス科 ,  クローン ,  *事例研究 ,  *ダウンレギュレーション ,  HIV感染症 ,  *HIV【ウイルス】 ,  *CD4抗原
準シソーラス用語： 免疫回避 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Nef ,  HIV進化 ,  縦 ,  CD4 ,  HLA ,  SERINC5

分類 (1件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

引用文献 (72件)：

• AIDS Rev.; HIV evolutionary dynamics within and among hosts; P Lemey, A Rambaut, OG Pybus; 8; 3; 2006; 125-140; citation_id=CR1
• Nature; Architecture and secondary structure of an entire HIV-1 RNA genome; JM Watts, KK Dang, RJ Gorelick, CW Leonard, JW Bess, R Swanstrom; 460; 7256; 2009; 711-716; 10.1038/nature08237; citation_id=CR2
• Microbiol Mol Biol Rev; HIV genome-wide protein associations: a review of 30 years of research; G Li, E Clercq; 80; 3; 2016; 679-731; 10.1128/MMBR.00065-15; citation_id=CR3
• Nat Rev Genet; The causes and consequences of HIV evolution; A Rambaut, D Posada, KA Crandall, EC Holmes; 5; 1; 2004; 52-61; 10.1038/nrg1246; citation_id=CR4
• Science; The accuracy of reverse transcriptase from HIV-1; JD Roberts, K Bebenek, TA Kunkel; 242; 4882; 1988; 1171-1173; 10.1126/science.2460925; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (9件)： HIV ,  CD4 ,  HLA ,  ダウンレギュレーション ,  活性 ,  長期 ,  宿主 ,  進化 ,  研究