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J-GLOBAL ID：202002277483497740   整理番号：20A2776870

新皮質細胞型のコミュニティベースのトランスクリプトミクス分類と命名【JST・京大機械翻訳】

A community-based transcriptomics classification and nomenclature of neocortical cell types

著者 (73件)： Yuste Rafael (Columbia University, New York City, NY, USA) ,  Hawrylycz Michael (Allen Institute for Brain Science, Seattle, WA, USA) ,  Aalling Nadia (University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark) ,  Aguilar-Valles Argel (Carleton University, Ottawa, Ontario, Canada) ,  Arendt Detlev (European Molecular Biology Laboratory Heidelberg, Heidelberg, Germany) ,  Arnedillo Ruben Armananzas (George Mason University, Fairfax, VA, USA) ,  Ascoli Giorgio A. (George Mason University, Fairfax, VA, USA) ,  Bielza Concha (Technical University of Madrid, Madrid, Spain) ,  Bokharaie Vahid (Max Planck Institute, Tuebingen, Germany) ,  Bergmann Tobias Borgtoft (University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark) ,  Bystron Irina (University of Oxford, Oxford, UK) ,  Capogna Marco (Aarhus University, Aarhus, Denmark) ,  Chang Yoonjeung (Harvard Medical School, Cambridge, MA, USA) ,  Clemens Ann (The University of Edinburgh, Edinburgh, UK) ,  de Kock Christiaan P. J. (Vrije Universiteit Amsterdam, Amsterdam, Netherlands) ,  DeFelipe Javier (Cajal Institute, Madrid, Spain) ,  Dos Santos Sandra Esmeralda (Vanderbilt University, Nashville, TN, USA) ,  Dunville Keagan (Scuola Normale Superior, Pisa, Italy) ,  Feldmeyer Dirk (JARA-Brain Institute of Neuroscience and Medicine, Julich, Germany) ,  Fiath Richard (Research Centre for Natural Sciences, Budapest, Hungary) ,  Fishell Gordon James (Harvard Medical School, Cambridge, MA, USA) ,  Foggetti Angelica (Christian-Albrechts-University Kiel, Kiel, Germany) ,  Gao Xuefan (European Molecular Biology Laboratory, Hamburg, Germany) ,  Ghaderi Parviz (Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne, Switzerland) ,  Goriounova Natalia A. (Vrije Universiteit Amsterdam, Amsterdam, Netherlands) ,  Guentuerkuen Onur (Ruhr University Bochum, Bochum, Germany) ,  Hagihara Kenta (Friedrich Miescher Institute for Biological Research, Basel, Switzerland) ,  Hall Vanessa Jane (University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark) ,  Helmstaedter Moritz (Max Planck Institute for Brain Research, Frankfurt, Germany) ,  Herculano Suzana (Vanderbilt University, Nashville, TN, USA) ,  Hilscher Markus M. (Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden) ,  Hirase Hajime (RIKEN Center for Brain Science, Saitama, Japan) ,  Hjerling-Leffler Jens (Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden) ,  Hodge Rebecca (Allen Institute for Brain Science, Seattle, WA, USA) ,  Huang Josh (Cold Spring Harbor Laboratory, Laurel Hollow, NY, USA) ,  Huda Rafiq (Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, USA) ,  Khodosevich Konstantin (University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark) ,  Kiehn Ole (University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark) ,  Koch Henner (RWTH Aachen University, Aachen, Germany) ,  Kuebler Eric S. (Robarts Research Institute, London, Ontario, Canada) ,  Kuehnemund Malte (CARTANA, Stockholm, Sweden) ,  Larranaga Pedro (Technical University of Madrid, Madrid, Spain) ,  Lelieveldt Boudewijn (Leiden University, Leiden, Netherlands) ,  Louth Emma Louise (Aarhus University, Aarhus, Denmark) ,  Lui Jan H. (Stanford University, Stanford, CA, USA) ,  Mansvelder Huibert D. (Vrije Universiteit Amsterdam, Amsterdam, Netherlands) ,  Marin Oscar (King’s College London, London, UK) ,  Martinez-Trujillo Julio (University of Western Ontario, London, Ontario, Canada) ,  Moradi Chameh Homeira (Krembil Research Institute, Toronto, Ontario, Canada) ,  Nath Alok (University of Haifa, Haifa, Israel) ,  Nedergaard Maiken (Univeristy of Rochester, Rochester, NY, USA) ,  Nemec Pavel (Charles University, Prague, Czech Republic) ,  Ofer Netanel (Bar Ilan University, Ramat Gan, Israel) ,  Pfisterer Ulrich Gottfried (University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark) ,  Pontes Samuel (Columbia University, New York City, NY, USA) ,  Redmond William (Macquarie University, Sydney, New South Wales, Australia) ,  Rossier Jean (Sarbonne University, Paris, France) ,  Sanes Joshua R. (Harvard Medical School, Cambridge, MA, USA) ,  Scheuermann Richard (J. Craig Venter Institute, La Jolla, CA, USA) ,  Serrano-Saiz Esther (Severo Ochoa Center for Molecular Biology, Madrid, Spain) ,  Steiger Jochen F. (University of Gottingen, Gottingen, Germany) ,  Somogyi Peter (University of Oxford, Oxford, UK) ,  Tamas Gabor (University of Szeged, Szeged, Hungary) ,  Tolias Andreas Savas (Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA) ,  Tosches Maria Antonietta (Columbia University, New York City, NY, USA) ,  Garcia Miguel Turrero (Harvard Medical School, Cambridge, MA, USA) ,  Vieira Hermany Munguba (Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden) ,  Wozny Christian (University of Strathclyde, Glasgow, UK) ,  Wuttke Thomas V. (University of Tuebingen, Tuebingen, Germany) ,  Yong Liu (School of Engineering, New York University, New York, NY, USA) ,  Yuan Juan (Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden) ,  Zeng Hongkui (Allen Institute for Brain Science, Seattle, WA, USA) ,  Lein Ed (Allen Institute for Brain Science, Seattle, WA, USA)
資料名： Nature Neuroscience  (Nature Neuroscience)
巻： 23  号： 12  ページ： 1456-1468  発行年： 2020年 
JST資料番号： W1370A  ISSN： 1097-6256  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 皮質回路の機能を理解するためには,それらの細胞多様性をカタログする必要がある。皮質細胞の解剖学的,生理学的または分子的特徴を利用するための過去の試みは,部分的に限られたデータのため,ニューロンまたはグリア細胞型の統一した分類学をもたらさない。単細胞トランスクリプトミクスは,初めて,皮質細胞の系統的ハイスループット測定と,完全で,正確で,永続的である有望なデータセットの生成を可能にする。これらのデータの統計解析は,形態学的または生理学的基準によって以前に定義された細胞型にしばしば対応するクラスタを明らかにし,皮質領域および種にわたって保存されているようである。これらの新しい方法を資本化するために,哺乳類新皮質に対する細胞型のトランスクリプトームに基づく分類の採用を提案した。この分類は階層的であり,標準化命名法を使用するべきである。それは,細胞型の確率的定義に基づき,異なるアプローチ,発達段階,および種からのデータを組み込むべきである。知識グラフのようなコミュニティベースの分類とデータ集約モデルは,皮質回路の研究に共通の基礎を提供する。このコミュニティベースの分類,命名法,およびデータ集約は,体の他の部分における細胞型アトラスの例として役立つ可能性がある。Copyright The Author(s) 2020. corrected publication 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 標準化 ,  ニューロン ,  命名法 ,  哺乳類 ,  *皮質 ,  クラスタ ,  グリア細胞 ,  成長段階 ,  解剖学 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *新皮質 ,  *トランスクリプトーム解析 ,  ハイスループット ,  単一細胞 ,  *細胞型 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 中枢神経系  (EJ12030F)

タイトルに関連する用語 (6件)： 新皮質 ,  細胞型 ,  コミュニティ ,  トランスクリプトミクス ,  分類 ,  命名