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J-GLOBAL ID：202002277944464250   整理番号：20A2755668

腸内マイクロバイオームに対する抗生物質の効果:抗生物質処置マウスにおける微生物シフトと腸内抗生物質耐性のメタゲノミクス解析【JST・京大機械翻訳】

The effect of antibiotics on the gut microbiome: a metagenomics analysis of microbial shift and gut antibiotic resistance in antibiotic treated mice

著者 (10件)： Xu Lei (U. S. Food and Drug Administration, Center for Drug Evaluation and Research, Office of Translational Science, Office of Clinical Pharmacology, Division of Applied Regulatory Science, HFD-910, White Oak Federal Research Center, Silver Spring, USA) ,  Surathu Anil (U. S. Food and Drug Administration, Center for Drug Evaluation and Research, Office of Translational Science, Office of Clinical Pharmacology, Division of Applied Regulatory Science, HFD-910, White Oak Federal Research Center, Silver Spring, USA) ,  Raplee Isaac (U. S. Food and Drug Administration, Center for Drug Evaluation and Research, Office of Translational Science, Office of Clinical Pharmacology, Division of Applied Regulatory Science, HFD-910, White Oak Federal Research Center, Silver Spring, USA) ,  Chockalingam Ashok (U. S. Food and Drug Administration, Center for Drug Evaluation and Research, Office of Translational Science, Office of Clinical Pharmacology, Division of Applied Regulatory Science, HFD-910, White Oak Federal Research Center, Silver Spring, USA) ,  Stewart Sharron (U. S. Food and Drug Administration, Center for Drug Evaluation and Research, Office of Translational Science, Office of Clinical Pharmacology, Division of Applied Regulatory Science, HFD-910, White Oak Federal Research Center, Silver Spring, USA) ,  Walker Lacey (U. S. Food and Drug Administration, Center for Drug Evaluation and Research, Office of Translational Science, Office of Clinical Pharmacology, Division of Applied Regulatory Science, HFD-910, White Oak Federal Research Center, Silver Spring, USA) ,  Sacks Leonard (U. S. Food and Drug Administration, Center for Drug Evaluation and Research, Office of Medical Policy, White Oak Federal Research Center, Silver Spring, USA) ,  Patel Vikram (U. S. Food and Drug Administration, Center for Drug Evaluation and Research, Office of Translational Science, Office of Clinical Pharmacology, Division of Applied Regulatory Science, HFD-910, White Oak Federal Research Center, Silver Spring, USA) ,  Li Zhihua (U. S. Food and Drug Administration, Center for Drug Evaluation and Research, Office of Translational Science, Office of Clinical Pharmacology, Division of Applied Regulatory Science, HFD-910, White Oak Federal Research Center, Silver Spring, USA) ,  Rouse Rodney (U. S. Food and Drug Administration, Center for Drug Evaluation and Research, Office of Translational Science, Office of Clinical Pharmacology, Division of Applied Regulatory Science, HFD-910, White Oak Federal Research Center, Silver Spring, USA)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 21  号： 1  ページ： 1-18  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 抗生物質耐性の出現は世界的な公衆衛生上の懸念である。抗生物質使用,腸群集組成,正常生理学および代謝,および個人および公衆衛生の間の関係はまだ定義されている。抗生物質処理後の細菌,抗生物質耐性遺伝子(ARGs)および移動性遺伝要素(MGEs)の組成におけるシフトは,十分に理解されていない。このプロジェクトは,次世代シークエンシング,特注のメタゲノムパイプライン,および異なる豊度分析を使用して,抗生物質耐性の進化と出現を調査するために,経尿道カテーテル法を介して大腸菌に感染したBalb/cマウスの腸におけるレジストームと分類学的組成に及ぼす抗生物質単剤療法の影響を研究した。抗生物質処理後の腸微生物叢多様性の長期的減少がある。抗生物質処理後の細菌の多様性と総量の全体的減少にもかかわらず,種々のARGsは腸内微生物叢内に豊富である。完全に異なるクラスの抗生物質に耐性のあるARGsのために選択した抗生物質の特定のクラス(例えば,アンピシリンに耐性のあるセファマイシンまたはホスホマイシンの処理)を選択した。いくつかのMGEsの相対存在量は,抗生物質処理後に実質的に増加した(例えばシプロフロキサシン群のトランスポザーゼ)。抗生物質処理は腸内細菌微生物叢の多様性を著しく減少させたが,ある種のARGsとMGEsの濃縮をもたらした。これらの結果は,抗生物質の経口投与後の腸レジストームにおける交差耐性の出現と大きな変化を示す。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *微生物 ,  細菌 ,  大腸菌 ,  遺伝子 ,  *抗生物質 ,  腸内微生物 ,  公衆衛生 ,  ミクロフローラ ,  脂環式化合物 ,  窒素複素環化合物 ,  芳香族フッ素化合物 ,  芳香族縮合化合物 ,  ケト酸 ,  酸素複素環化合物 ,  ホスホン酸 ,  アミノ酸 ,  芳香族化合物 ,  ラクタム ,  硫黄複素環化合物 ,  第一アミン
準シソーラス用語： 腸内細菌 ,  *メタゲノミクス ,  メタゲノム ,  抗生物質耐性遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 腸内マイクロバイオーム ,  次世代シークエンシング ,  抗生物質 ,  抗生物質耐性 ,  メタゲノム

分類 (5件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  その他の汚染原因物質  (SB05040W) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  抗生物質一般  (GX01000E)

物質索引 (3件)： シプロフロキサシン ,  ホスホマイシン ,  アンピシリン

引用文献 (76件)：

• Antibiotic/Antimicrobial Resistance (AR/AMR). 2018. Available from: https://www.cdc.gov/drugresistance/index.html. [cited 10/4/2018].
• WHO. Antimicrobial resistance: global report on surveillance. Geneva: World Health Organization; 2014. https://www.who.int/antimicrobial-resistance/publications/surveillancereport/en/. Accessed 4 Oct 2018.
• Executive order 13676: combating antibiotic-resistant bacteria. 2014. Available from: https://obamawhitehouse.archives.gov/the-press-office/2014/09/18/executive-order-combating-antibiotic-resistant-bacteria. [cited 2018 10/4/2018].
• Appl Microbiol Biotechnol; Strategies to prevent the occurrence of resistance against antibiotics by using advanced materials; A Bassegoda; 102; 5; 2018; 2075-2089; 10.1007/s00253-018-8776-0; citation_id=CR4
• Coussement J, et al. Antibiotics for asymptomatic bacteriuria in kidney transplant recipients. Cochrane Database Syst Rev. 2018;2:CD011357. https://doi.org/10.1002/14651858.CD011357.pub2.

タイトルに関連する用語 (10件)： 腸 ,  マイクロバイオーム ,  抗生物質 ,  処置 ,  マウス ,  微生物 ,  シフト ,  抗生物質耐性 ,  メタゲノミクス ,  解析