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J-GLOBAL ID：202002278192001682   整理番号：20A2470410

モロッコの都市および農村集団からのミトコンドリア蛋白質をコード化する核遺伝子の差次的発現【JST・京大機械翻訳】

Differential expression of nuclear genes encoding mitochondrial proteins from urban and rural populations in Morocco

著者 (20件)： Bickler Stephen W. (Division of Pediatric Surgery, Rady Children’s Hospital-University of California San Diego, San Diego, CA, USA) ,  Bickler Stephen W. (Department of Surgery, School of Medicine, University of California San Diego, La Jolla, CA, USA) ,  Bickler Stephen W. (Center for Investigations of Health and Education Disparities, University of California San Diego, La Jolla, CA, USA) ,  Prieto James M. (Department of Surgery, Naval Medical Center San Diego, San Diego, CA, USA) ,  Cauvi David M. (Department of Surgery, School of Medicine, University of California San Diego, La Jolla, CA, USA) ,  Cauvi David M. (Center for Investigations of Health and Education Disparities, University of California San Diego, La Jolla, CA, USA) ,  De Cos Victor (Division of Pediatric Surgery, Rady Children’s Hospital-University of California San Diego, San Diego, CA, USA) ,  Nasamran Chanond (Center for Computational Biology and Bioinformatics, University of California San Diego, La Jolla, CA, USA) ,  Ameh Emmanuel (Department of Pediatric Surgery, National Hospital, Abuja, Nigeria) ,  Amin Said (Department of Histopathology, National Hospital, Abuja, Nigeria) ,  Nicholson Sneha (Division of Pediatric Surgery, Rady Children’s Hospital-University of California San Diego, San Diego, CA, USA) ,  Din Hena (Division of Pediatric Surgery, Rady Children’s Hospital-University of California San Diego, San Diego, CA, USA) ,  Mocumbi Ana Olga (Instituto Nacional de Saude, Maputo, Mozambique) ,  Mocumbi Ana Olga (Department of Microbiology, Faculty of Medicine, Universidade Eduardo Mondlane (UEM), Maputo, Mozambique) ,  Noormahomed Emilia Virginia (Department of Microbiology, Faculty of Medicine, Universidade Eduardo Mondlane (UEM), Maputo, Mozambique) ,  Tellez-Isaias Guillermo (Department of Poultry Science, University of Arkansas, Fayetteville, AR, USA) ,  Fisch Kathleen M. (Center for Computational Biology and Bioinformatics, University of California San Diego, La Jolla, CA, USA) ,  De Maio Antonio (Department of Surgery, School of Medicine, University of California San Diego, La Jolla, CA, USA) ,  De Maio Antonio (Center for Investigations of Health and Education Disparities, University of California San Diego, La Jolla, CA, USA) ,  De Maio Antonio (Department of Neurosciences, School of Medicine, University of California San Diego, La Jolla, CA, USA)
資料名： Cell Stress & Chaperones  (Cell Stress & Chaperones)
巻： 25  号： 6  ページ： 847-856  発行年： 2020年 
JST資料番号： W1729A  ISSN： 1355-8145  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 低所得国の都市化は,病気の疫学における重要な変曲点であり,農村個体群は,非伝染性疾患のプロファイルを示す,慢性および再発性感染および都市集団の高い率を経験する。都市化がミトコンドリア蛋白質をコードする遺伝子の発現を変化させるかどうかを調べるために,モロッコ(GSE17065)に住む農村および都市集団からの遺伝子マイクロアレイデータを質問した。RバイオコンダクタパッケージエッジRとリムマを用いて,異なる発現を有する遺伝子を同定した。実験計画を,位置と性に関してモデル化した。ミトコンドリア蛋白質をコードする核遺伝子をMitoCarta2.0データベースから同定した。MitoCarta2.0データベースに記載された1158の遺伝子のうち,847の遺伝子(73%)がモロッカンデータセットの分析のために利用可能であった。最大の環境差との都市-農村比較は,MitoCarta2.0遺伝子の76.5%が差次的に発現し,都市域で発現が増加した遺伝子の97%であることを示した。濃縮分析は,酸化リン酸化,インシュリン分泌およびグルコース調節(adj.p値=6.93E-16)がトップ3である367の有意に豊富な経路(調整p値<0.05)を明らかにした。4つの有意に混乱したKEGG疾患経路は,都市化3変性神経疾患(Huntington,アルツハイマー病,およびParkinson病)と単純ヘルペスウイルス感染(false発見率補正p値(PGFdr)<0.2)と関連していた。ミトコンドリアRNA代謝処理および翻訳伸長は,最大濃縮(濃縮比14.0および14.8,FDR<0.5)を有する生物学的プロセスであった。本研究は,ミトコンドリア蛋白質をコードする核遺伝子の発現における変化とモロッコの都市化を結びつけた。Copyright Cell Stress Society International 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 酸化 ,  データベース ,  *都市 ,  RNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  ヒト ,  *ミトコンドリア ,  都市化 ,  *農村 ,  個体群 ,  疫学 ,  遺伝子発現 ,  DNAマイクロアレイ
準シソーラス用語： *ミトコンドリア蛋白質 ,  *差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： ヒト ,  都市化 ,  非伝染性疾患 ,  RNA ,  ミトコンドリア ,  モロッコ ,  遺伝子発現

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  集団遺伝学  (EC01040J)

タイトルに関連する用語 (7件)： モロッコ ,  都市 ,  農村 ,  集団 ,  ミトコンドリア蛋白質 ,  核遺伝子 ,  差次的発現