抄録/ポイント：
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ABSTRACT抗菌剤耐性遺伝子(ARGs)とそれらを保有する細菌は,環境,特に表面水,下水処理施設排水,土壌,および動物廃棄物で広く分布している。本研究では,日本の東京湾のサンプリングサイトからKPC-2生産Klebsiella pneumoniae株(GSU10-3)を分離し,その完全なゲノム配列を決定した。菌株GSU10-3は,ほとんどのβ-ラクタム抗生物質および他の抗菌剤(キノロンおよびアミノグリコシド)に耐性がある。この株は配列タイプ11(ST11)として分類され,コアゲノム系統発生分析は,菌株GSU10-3が2011年から2017年までのKPC-2陽性中国人臨床分離株に密接に関連しており,欧州連合(EU),米国,および他のアジア諸国から分離された株とは明らかに異なることを示した。菌株GSU10-3は,bla_KPC-2陽性プラスミド,pGSU10-3-3(66.2kb)を含む4つのプラスミドを持ち,これは他のbla_KPC-2陽性プラスミドよりも小さく,特に二重レプリコン(IncFII[pHN7A8]とIncN)を運ぶ。このようなダウンサイジングと二重レプリコンの存在は,その維持と安定な複製を促進し,低い適応コストでその広い宿主範囲に寄与する。IncA/C2レプリコンであるpGSU10-3-1(159.0kb)の2番目のプラスミドはクラス1インテグロン(intI1,dfrA12,aadA2,qacEΔ1,およびsul1)を有し,腸内細菌科に存在する広宿主範囲プラスミドと高度の相同性を有する。プラスミドpGSU10-3-2(134.8kb),IncFII(K)レプリコンは,IS26媒介ARG[aac(6’)Ib-cr,bla_OXA-1,catB4(切断),およびaac(3)-IId],tet(A),および銅/ヒ酸塩耐性遺伝子座を運ぶ。GSU10-3は,全ゲノムが配列決定されている日本からの最初の非臨床KPC-2産生環境腸内細菌科分離株である。下水処理場(WWTP)近くの東京湾のサンプリングサイトから,KPC-2産生K.pneumoniae株の完全ゲノム配列を分離し,決定した。日本では,KPC型は非常に稀であるが,IMPは臨床カルバペネマーゼ産生腸内細菌科(CPE)分離株におけるカルバペネマーゼの最も優勢なタイプである。実験室試験は,これまで,日本がKPC生産腸内細菌科を実質的に含んでいないことを示唆したが,WWTPからの排水からそれを検出した。WWTP排水の抗菌剤耐性(AMR)モニタリングは,臨床設定とコミュニティにおける将来のAMR細菌普及の早期検出に寄与する可能性がある;実際,WWTP排水による環境汚染が一部を果たす全体像を明らかにするのに役立つであろう。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
