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J-GLOBAL ID：202002279404173441   整理番号：20A0478069

Hilbert-Schmidt独立基準を用いた多変量情報融合による膜蛋白質タイプの同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of membrane protein types via multivariate information fusion with Hilbert-Schmidt Independence Criterion

著者 (6件)： Wang Hao (School of Computer Science and Technology, College of Intelligence and Computing, Tianjin University, Tianjin 300350, China) ,  Ding Yijie (School of Electronic and Information Engineering, Suzhou University of Science and Technology, Suzhou, China) ,  Tang Jijun (School of Computer Science and Technology, College of Intelligence and Computing, Tianjin University, Tianjin 300350, China) ,  Tang Jijun (Department of Computer Science and Engineering, University of South Carolina, Columbia, SC 29208, USA) ,  Tang Jijun (Key Laboratory of Systems Bioengineering (Ministry of Education), Tianjin University, Tianjin, China) ,  Guo Fei (School of Computer Science and Technology, College of Intelligence and Computing, Tianjin University, Tianjin 300350, China)
資料名： Neurocomputing  (Neurocomputing)
巻： 383  ページ： 257-269  発行年： 2020年 
JST資料番号： W0360A  ISSN： 0925-2312  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 膜蛋白質は,オキシドレダクターゼ,トランスフェラーゼまたはヒドロラーゼのような生物の生存に重要な様々な機能を果たす。膜蛋白質のタイプを検出できれば,蛋白質の機能は迅速に決定できる。多くの既存の計算法は,アミノ酸の疎水性指標に対する自己相関関数を用いるだけでなく,一次蛋白質配列の進化的保存情報も考慮している。本研究では,平均ブロック(Avブロック),離散ウェーブレット変換(DWT),離散コサイン変換(DCT),指向勾配(HOG)のヒストグラムおよび擬似PSSM(PsePSSM)を用いて,位置特異スコア行列(PSSM)からの進化特性を抽出した。次に,上記の5つの対応する特徴集合から5つのカーネルを構築した。最後に,著者らは,膜蛋白質を同定するために,5つのカーネルを統合するために,Hilbert Schmidt独立性基準(HSIC)に基づく新しい多重カーネルサポートベクトルマシン(MKSVM)分類器を提案した。性能評価のために,著者らの方法を膜蛋白質の4つのベンチマークデータセットで試験した。比較結果は,著者らの予測モデルがすべての既存の優れたアプローチの中で最良の性能を達成することを実証した。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アミノ酸 ,  トランスフェラーゼ ,  特徴抽出 ,  ヒドロラーゼ ,  アミノ酸配列 ,  多重化 ,  予測モデル ,  ベンチマーク ,  DCT【変換】 ,  *膜タンパク質 ,  オキシドレダクターゼ ,  *タンパク質 ,  疎水性 ,  自己相関関数 ,  ヒストグラム

著者キーワード (5件)： 膜蛋白質 ,  位置特定スコア行列 ,  多重カーネル学習 ,  多変量情報融合 ,  特徴抽出

分類 (2件)： ニューロコンピュータ  (JC06010Q) ,  人工知能  (JE08000Z)

タイトルに関連する用語 (5件)： 多変量 ,  情報融合 ,  膜蛋白質 ,  タイプ ,  同定