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J-GLOBAL ID：202002279713199473   整理番号：20A2696744

多発外傷スクリーニングコホートにおけるSepsisリスクの早期予測のための多遺伝子リスクスコア【JST・京大機械翻訳】

Polygenic Risk Score for Early Prediction of Sepsis Risk in the Polytrauma Screening Cohort

著者 (11件)： Lu Hongxiang (State Key Laboratory of Trauma, Burns and Combined Injury, Wound Trauma Medical Center, Institute of Surgery Research, Daping Hospital, Army Medical University, Chongqing, China) ,  Lu Hongxiang (Department of Traumatic Orthopaedics, General Hospital of Xinjiang Militarary Region, Urumuqi, China) ,  Wen Dalin (State Key Laboratory of Trauma, Burns and Combined Injury, Wound Trauma Medical Center, Institute of Surgery Research, Daping Hospital, Army Medical University, Chongqing, China) ,  Sun Jianhui (State Key Laboratory of Trauma, Burns and Combined Injury, Wound Trauma Medical Center, Institute of Surgery Research, Daping Hospital, Army Medical University, Chongqing, China) ,  Du Juan (State Key Laboratory of Trauma, Burns and Combined Injury, Wound Trauma Medical Center, Institute of Surgery Research, Daping Hospital, Army Medical University, Chongqing, China) ,  Qiao Liang (College of Biomedical Engineering, Army Medical University, Chongqing, China) ,  Zhang Huacai (State Key Laboratory of Trauma, Burns and Combined Injury, Wound Trauma Medical Center, Institute of Surgery Research, Daping Hospital, Army Medical University, Chongqing, China) ,  Zeng Ling (State Key Laboratory of Trauma, Burns and Combined Injury, Wound Trauma Medical Center, Institute of Surgery Research, Daping Hospital, Army Medical University, Chongqing, China) ,  Zhang Lianyang (State Key Laboratory of Trauma, Burns and Combined Injury, Wound Trauma Medical Center, Institute of Surgery Research, Daping Hospital, Army Medical University, Chongqing, China) ,  Jiang Jianxin (State Key Laboratory of Trauma, Burns and Combined Injury, Wound Trauma Medical Center, Institute of Surgery Research, Daping Hospital, Army Medical University, Chongqing, China) ,  Zhang Anqiang (State Key Laboratory of Trauma, Burns and Combined Injury, Wound Trauma Medical Center, Institute of Surgery Research, Daping Hospital, Army Medical University, Chongqing, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 11  ページ： 545564  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:敗血症に関連する遺伝的変異の増加は候補遺伝子およびゲノムワイド関連研究により同定されているが,単一変異体はリスク予測における最小変化を与えた。目的は,複数の変異体から情報を凝集する重み付き遺伝的リスクスコア(wGRS)が,外傷性敗血症のリスク識別を改善できるかどうかを評価することである。【方法】敗血症に関連する64の遺伝的変異の可能性を,中国の外傷コホートにおいて遺伝子型を決定した。ランダムフォレストアルゴリズムによる平均減少精度(MDA)>1.0を有する遺伝的変異を,マルチ遺伝子座wGRSを構築するために選択した。曲線下面積(AUC)と正味再分類改善(NRI)を採用して,加重遺伝的リスクスコア(wGRS)の識別と再分類能力を評価した。結果:17の変異体を抽出し,883の外傷患者におけるwGRSを構築した。wGRSは,年齢,性別およびISSにより調整した後,外傷後の敗血症と有意に関連していた(OR=2.19,95%CI=1.53-3.15,P=2.01×10-5)。より高いwGRSを有する患者は,外傷性敗血症(P_trend=6.81×10-8),より高いSOFA(P_trend=5.00×10-3),およびAPACHE IIスコア(P_trend=1.00×10-3)の発生率が増加している。臨床変数へのwGRSを組み込んだリスク予測モデルのAUCは0.768(95%CI=0.739~0.796)で,臨床因子のみのモデルに対して3.40%(P=8.00×10-4)の増加があった。さらに,NRIは25.18%(95%CI=17.84~32.51%)増加した(P=6.00×10-5)。結論:著者らの知見は,遺伝的変異体が敗血症に対するリスクモデルの予測力を増強し,外傷患者の応用を強調し,敗血症リスク評価モデルが高リスク集団に対する有望なスクリーニングと予測ツールであることを示唆する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  *遺伝子 ,  遺伝子型 ,  敗血症 ,  *母集団 ,  血中濃度-時間曲線下面積 ,  リスク評価 ,  細菌感染症
準シソーラス用語： 遺伝的変異 ,  候補遺伝子 ,  *リスクスコア ,  ランダムフォレスト ,  危険予測 ,  遺伝的リスク , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 外傷 ,  敗血症 ,  予測 ,  遺伝子変異体 ,  重み付き遺伝的リスクスコア

分類 (3件)： 代謝異常・栄養性疾患一般  (GD05010J) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (38件)：

• AbrahamG.InouyeM. (2015). Genomic risk prediction of complex human disease and its clinical application. Curr. Opin. Genet. Dev. 33 10-16. doi: 10.1016/j.gde.2015.06.005 26210231
• ArcaroliJ.FesslerM. B.AbrahamE. (2005). Genetic polymorphisms and sepsis. Shock 24 300-312.
• BronkhorstM. W.PatkaP.Van LieshoutE. M. (2015). Effects of Sequence Variations in Innate Immune Response Genes on Infectious Outcome in Trauma Patients: A Comprehensive Review. Shock 44 390-396. doi: 10.1097/shk.0000000000000450 26473437
• BrouwerM. C.ReadR. C.van de BeekD. (2010). Host genetics and outcome in meningococcal disease: a systematic review and meta-analysis. Lancet Infect. Dis. 10 262-274. doi: 10.1016/S1473-3099(10)70045-1
• ChangJ.HuangY.WeiL.MaB.MiaoX.LiY. (2013). Risk prediction of esophageal squamous-cell carcinoma with common genetic variants and lifestyle factors in Chinese population. Carcinogenesis 34 1782-1786. doi: 10.1093/carcin/bgt106 23536576

タイトルに関連する用語 (5件)： 多発外傷 ,  リスク ,  早期 ,  予測 ,  多遺伝子リスクスコア