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J-GLOBAL ID：202002280318163078   整理番号：20A1120718

Copiaレトロトランスポゾンのスクリーニング多様性と分布は倍数体Hordeum murinum複合体のゲノムにおけるBARE1要素の特異的増幅を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Screening diversity and distribution of Copia retrotransposons reveals a specific amplification of BARE1 elements in genomes of the polyploid Hordeum murinum complex

著者 (9件)： Ourari Malika (Laboratory of Ecology and Environment, Department of Environment Biological Sciences, Faculty of Nature and Life Sciences, Universite de Bejaia, Bejaia, Algeria) ,  Coriton Olivier (Institut National de Recherche en Agriculture, Alimentation et Environnement, UMR1349 INRAE-AgroCampus Ouest-Universite de Rennes 1, Le Rheu Cedex, France) ,  Martin Guillaume (CIRAD, UMR AGAP, Montpellier, France) ,  Martin Guillaume (Universite de Montpellier, AGAP, CIRAD, INRA, Montpellier SupAgro, Montpellier, France) ,  Huteau Virginie (Institut National de Recherche en Agriculture, Alimentation et Environnement, UMR1349 INRAE-AgroCampus Ouest-Universite de Rennes 1, Le Rheu Cedex, France) ,  Keller Jean (Universite de Toulouse, LRSV, CNRS, UPS, Auzeville-Tolosane, France) ,  Ainouche Malika-Lily (Universite de Rennes 1, UMR-CNRS 6553, EcoBio, Rennes Cedex, France) ,  Amirouche Rachid (Universite des Sciences et de la Technologie Houari Boumediene, Faculte des Sciences Biologiques, Lab. LBPO, Alger, Algerie) ,  Ainouche Abdelkader (Universite de Rennes 1, UMR-CNRS 6553, EcoBio, Rennes Cedex, France)
資料名： Genetica  (Genetica)
巻： 148  号： 2  ページ： 109-123  発行年： 2020年 
JST資料番号： C0542A  ISSN： 0016-6707  CODEN： GENEA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 著者らは,Hordeum murinum倍数体複合体および関連分類群のゲノムにおけるTy1-copiaレトロトランスポゾンの多様性,分布および進化動力学を調査した。逆転写酵素配列の系統発生的および蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)分析は,これらのゲノムにおける4つのCopiaファミリーを同定した:優勢なBARE1(3つのグループまたはサブファミリー,A,BおよびCを含む)およびより少ないRIRE1,IKYAおよびTAR-1。BARE1ファミリーの中で,BARE1-AエレメントとBARE1-Bエレメントのサブグループ(B1と命名)は,H.murinum複合体(H.murinumとH.leporinum)の異質倍数体メンバーとそれらの現存する二倍体前駆体,亜種glaucumにおいて増殖した。さらに,調査した各Hordeum種内のBARE1-B元素の特異的増幅を見出した。異質倍数体細胞型におけるRIRE1,IKYAおよびTAR-1要素の低い発生は,それらがそれらの二倍体前駆細胞において弱く表現されているか,または高度に退化していることを示唆している。結果は,BARE1-AとBARE1-B1 Copia要素がH.murinum複合体のゲノムで特に良く表現され,そのゲノム特徴を構成することを示す。BARE1-Aおよび-B1ホモログは,参照オオムギゲノムにおいて検出されなかった。murinum複合体の二倍体,四倍体および六倍体分類群の染色体を横切るRT-Copiaプローブの類似の分布は,倍数体化後の増殖の証拠を示さない。Copyright Springer Nature Switzerland AG 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 染色体 ,  系統発生 ,  *ゲノム ,  *複合体 ,  四倍体 ,  *倍数体 ,  二倍体 ,  *スクリーニング ,  六倍体 ,  *レトロトランスポゾン ,  *オオムギ属 ,  FISH
準シソーラス用語： 亜種 ,  異質倍数体 ,  倍数体化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Hordeum ,  転移性要素 ,  系統発生 ,  in situハイブリダイゼーション ,  倍数性

分類 (3件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  麦  (FC03033M) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (10件)： レトロトランスポゾン ,  スクリーニング ,  多様性 ,  分布 ,  倍数体 ,  Hordeum ,  複合体 ,  ゲノム ,  要素 ,  増幅