抄録/ポイント:
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ABSTRACT市販プロバイオティック細菌は,病原体への潜在的移動を避けるため,後天性抗生物質耐性要素に対して試験する必要がある。ヨーロッパ食品安全当局は,Bifidobacterium属に対する阻害閾値を確立するために以前に使用された微量希釈培養技術を用いて試験抵抗性を推薦する。多くのBifidobacterium animalis subsp.lactis株はテトラサイクリンに対する耐性の増加を示し,歴史的にリボソーム保護遺伝子tet(W)に起因する。しかし,遺伝的に同一のtet(W)遺伝子を持ついくつかの株は,種々の阻害レベルを示し,他の遺伝要素も観察された差異に寄与することを示唆する。ここでは,B.animalis subsp.lactis株Bl-04およびHN019の阻害を確認するためにいくつかの分子アッセイを適用し,RNA配列決定を用いてゲノム多型に関連する転写差を評価した。液滴デジタルPCRから生存ゲノムコピーの数にATP濃度を相関させることによって抗生物質に対する特異的ストレス応答を検出し,細菌が高薬物濃度で代謝的に活性であることを見出した。転写分析は,いくつかの多型領域,特に新しい多剤排出輸送体が,表現型効果を有する,各々の実験条件で株間で異なって発現することを示した。また,tet(W)遺伝子はサブ阻害テトラサイクリン濃度においてのみアップレギュレートされ,一方,2つの新規テトラサイクリン耐性遺伝子は高濃度でアップレギュレートされた。さらに,アミノ酸代謝と輸送体機能に関与する多くの遺伝子がアップレギュレートされ,一方,複雑な炭水化物利用,蛋白質代謝,およびクラスター化された規則的に短いパリンドローム反復(s)(CRISPR)-Cas系に対する遺伝子が下方制御された。これらの結果は,2つの高度に関連するプロバイオティクス株の抗生物質耐性を評価するハイスループット手段を提供し,グローバルなテトラサイクリン応答に寄与する遺伝的ネットワークを決定する。IMPORTANC Bifidobacterium animalis subsp.lactisは,ヒト食品および栄養補助食品で広く使用されている。安全であると良く報告されているが,B.animalis subsp.lactis株は移動可能な抗生物質耐性要素を含まなかった。多くのB.animalis subsp.lactis株は遺伝的に類似であるにもかかわらず異なる耐性測定を有し,この理由はよく理解されていない。本研究では,2つの近縁産業B.animalis subsp.lactis株間のゲノム差異が,異なる耐性レベルにどのように寄与するかを調べた。これは,耐性のより良い理解につながり,移動可能性の分析のための将来の標的を同定し,細菌におけるテトラサイクリン耐性の理解を拡大した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】