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J-GLOBAL ID：202002280575149607   整理番号：20A1355573

ミトコンドリアゲノムの比較分析は線虫捕捉菌類への進化的洞察を提供する【JST・京大機械翻訳】

Comparative Analyses of Mitochondrial Genomes Provide Evolutionary Insights Into Nematode-Trapping Fungi

著者 (11件)： Zhang Ying (State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources in Yunnan, and Key Laboratory for Southwest Microbial Diversity of the Ministry of Education, Yunnan University, Kunming, China) ,  Yang Guangzhu (State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources in Yunnan, and Key Laboratory for Southwest Microbial Diversity of the Ministry of Education, Yunnan University, Kunming, China) ,  Yang Guangzhu (School of Life Sciences, Yunnan University, Kunming, China) ,  Fang Meiling (State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources in Yunnan, and Key Laboratory for Southwest Microbial Diversity of the Ministry of Education, Yunnan University, Kunming, China) ,  Fang Meiling (School of Life Sciences, Yunnan University, Kunming, China) ,  Deng Chu (State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources in Yunnan, and Key Laboratory for Southwest Microbial Diversity of the Ministry of Education, Yunnan University, Kunming, China) ,  Deng Chu (School of Life Sciences, Yunnan University, Kunming, China) ,  Zhang Ke-Qin (State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources in Yunnan, and Key Laboratory for Southwest Microbial Diversity of the Ministry of Education, Yunnan University, Kunming, China) ,  Yu Zefen (State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources in Yunnan, and Key Laboratory for Southwest Microbial Diversity of the Ministry of Education, Yunnan University, Kunming, China) ,  Xu Jianping (State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources in Yunnan, and Key Laboratory for Southwest Microbial Diversity of the Ministry of Education, Yunnan University, Kunming, China) ,  Xu Jianping (Department of Biology, McMaster University, Hamilton, ON, Canada)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 11  ページ： 617  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Orbiliaceae(Ascomycota)の捕食性真菌は,線虫,他の小動物および原生動物を捕獲し,殺すことを可能にする捕獲装置の多様性を進化させた。これらのトラッピング装置は,接着菌糸,接着剤knobs,接着ネットワーク,収縮リング,および非収縮リングを含む。それらの多様性と実際的重要性は生物学者から大きな注目を引きつけ,適応進化の研究と寄生線虫に対する生物防除剤として優れたモデル生物を作っている。これらの肉食性真菌間の推定起源と進化関係は,核蛋白質コード遺伝子を用いて研究されているが,それらのマイトゲノム関係と分岐のパターンは未知のままである。ここでは,8種に属する12の真菌菌株のミトノームを分析し,4タイプの線虫捕獲装置と2つの関連が非捕食性真菌を代表する6種を含む。すべての12の分析したマイトジェンは,円形DNA分子であり,長さは146,101bpから280,699bpであった。遺伝子シンテニー分析は,マイトジェン間のいくつかの遺伝子再配列とイントロン移動を明らかにした。加えて,蛋白質コード遺伝子(PCG),GC含有量,ATスキュー,およびGCスキューの数は,これらのマイトジェン間で変化した。イントロンの増加した数と全サイズは,マイトジェン間の長さ差に対する主要な寄与因子であった。蛋白質コード遺伝子の系統発生解析は,ミトコンドリアと核ゲノムが種々の速度で進化し,正の選択のシグナルがエネルギー代謝に関与するいくつかの遺伝子で見いだされたことを示した。本研究は線虫捕獲菌類の進化への新たな洞察を提供し,この生態学的および農業的に重要な真菌群のさらなる調査を促進する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 接着 ,  ネットワーク ,  原生動物 ,  DNA【核酸】 ,  *線虫類 ,  *ミトコンドリア ,  系統発生 ,  *ゲノム ,  真菌類 ,  マイトジェン ,  子嚢菌類 ,  イントロン ,  ゆがみ
準シソーラス用語： 捕食行動 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 昆虫病原性真菌 ,  アナモルフィックOrbiliaceae ,  ミトコンドリア系統発生 ,  適応進化 ,  rps3

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  生物的防除  (FC05030B)

引用文献 (77件)：

• Aguileta G., de Vienne D., Ross O., Hood M., Giraud T., Petit E., et al (2014). High variability of mitochondrial gene order among fungi. Genome Biol. Evol. 6 451-465. doi: 10.1093/gbe/evu028
• Ahren D., Ursing B. M., Tunlid A. (1998). Phylogeny of nematode-trapping fungi based on 18S rDNA sequences. FEMS Microbiol. Lett. 158 179-184. doi: 10.1016/S0378-1097(97)00519-3
• Bankevich A., Nurk S., Antipov D., Gurevich A., Dvorkin M., Kulikov A., et al (2012). SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing. J. Comput. Biol. 19 455-477. doi: 10.1089/cmb.2012.0021
• Barron G. L. (ed.) (1977). The Nematode-Destroying Fungi. [Topics in Mycology No. 1.]. Guelph: Canadian Biological Publications. doi: 10.1089/cmb.2012.0021
• Basse C. W. (2010). Mitochondrial inheritance in fungi. Curr. Opin. Microbiol. 13 712-719. doi: 10.1016/j.mib.2010.09.003

タイトルに関連する用語 (7件)： ミトコンドリアゲノム ,  比較分析 ,  線虫 ,  捕捉 ,  菌類 ,  進化 ,  洞察