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J-GLOBAL ID：202002280717840054   整理番号：20A0074253

比較ゲノミクスはOstariophysan魚におけるfright反応遺伝子の加速進化を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Comparative Genomics Reveals Accelerated Evolution of Fright Reaction Genes in Ostariophysan Fishes

著者 (15件)： Yang Liandong (1The Key Laboratory of Aquatic Biodiversity and Conservation of Chinese Academy of Sciences, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, China) ,  Jiang Haifeng (1The Key Laboratory of Aquatic Biodiversity and Conservation of Chinese Academy of Sciences, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, China) ,  Jiang Haifeng (2University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Chen Juan (1The Key Laboratory of Aquatic Biodiversity and Conservation of Chinese Academy of Sciences, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, China) ,  Chen Juan (2University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Lei Yi (1The Key Laboratory of Aquatic Biodiversity and Conservation of Chinese Academy of Sciences, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, China) ,  Lei Yi (2University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Sun Ning (1The Key Laboratory of Aquatic Biodiversity and Conservation of Chinese Academy of Sciences, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, China) ,  Sun Ning (2University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Lv Wenqi (1The Key Laboratory of Aquatic Biodiversity and Conservation of Chinese Academy of Sciences, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, China) ,  Lv Wenqi (2University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Near Thomas J. (3Department of Ecology and Evolutionary Biology and Peabody Museum of Natural History, Yale University, New Haven, CT, United States) ,  He Shunping (1The Key Laboratory of Aquatic Biodiversity and Conservation of Chinese Academy of Sciences, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, China) ,  He Shunping (4Institute of Deep Sea Science and Engineering, Chinese Academy of Sciences, Sanya, China) ,  He Shunping (5Center for Excellence in Animal Evolution and Genetics, Chinese Academy of Sciences, Kunming, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 10  ページ： 1283  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Ostariophysia魚類は淡水における最も種の豊富なクレードである。この多様化は,ほとんどのオスタリア人で示されたfright反応と関連していることが示唆されている。しかし,正しい反応の基礎となる遺伝的力はほとんど理解されていない。本研究では,行動,生理学,トランスクリプトーム,進化的ゲノム解析を統合することにより,fright反応が遊泳行動,コルチゾールレベル,遺伝子発現パターンの変化を含む複数レベルでゼブラフィッシュに広い影響を持つことを見出した。全体で,1,555および1,599の差次的に発現した遺伝子を,ゼブラフィッシュの嗅覚粘膜および脳においてそれぞれ同定し,より多くの数がfright反応後に上方制御された。機能的アノテーションにより,ストレスとシグナル伝達に対する応答は強く表現され,それは直接反応と関連していることが示された。これらの差次的に発現された遺伝子は正の選択の影響下で加速されることが示され,蛋白質コード進化がfright反応において主要な役割を果たしていることを示している。著者らは,基礎的なvo鼻型2受容体(V2R)遺伝子,v2rl1が,fright反応後に有意に減少した発現を示し,V2Rが警報物質を検出し,fright反応を誘導するのに重要であることを示唆した。まとめると,著者らのトランスクリプトームおよび進化的ゲノミクス解析に基づいて,遺伝子の転写可塑性がOstariophysia魚類におけるfright反応において重要な役割を果たしている可能性があることを示唆する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 嗅覚 ,  *遺伝子 ,  アノテーション ,  タンパク質 ,  アップレギュレーション ,  RNA【核酸】 ,  遊泳 ,  *遺伝 ,  粘膜 ,  直接反応 ,  受容体 ,  塑性 ,  トランスクリプトーム ,  警報 ,  ゼブラフィッシュ

著者キーワード (5件)： Ostariophysans ,  Fright反応 ,  RNA-seq ,  加速した進化 ,  正の選択

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (92件)：

• Ahuja G., Korsching S. (2014). Zebrafish olfactory receptor ORA1 recognizes a putative reproductive pheromone. Commun. Integr. Biol. 7, e970501. doi: doi: 10.4161/19420889.2014.970501
• Arcila D., Orti G., Vari R., Armbruster J. W., Stiassny M. L. J., Ko K. D., et al. (2017). Genome-wide interrogation advances resolution of recalcitrant groups in the tree of life. Nat. Ecol. Evol. 1, 20. doi: doi: 10.1038/s41559-016-0020
• Barton B. A., Iwama G. K. (1991). Physiological changes in fish from stress in aquaculture with emphasis on the response and effects of corticosteroids. Ann. Rev. Fish Dis. 1, 3-26. doi: doi: 10.1016/0959-8030(91)90019-G
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• Behrens M., Frank O., Rawel H., Ahuja G., Potting C., Hofmann T., et al. (2014). ORA1, a Zebrafish Olfactory Receptor Ancestral to All Mammalian V1R Genes, Recognizes 4-Hydroxyphenylacetic Acid, a Putative Reproductive Pheromone. J. Biol. Chem. 289, 19778-19788. doi: doi: 10.1074/jbc.M114.573162

タイトルに関連する用語 (2件)： 比較ゲノミクス ,  遺伝子