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J-GLOBAL ID：202002280994630481   整理番号：20A1408261

合成ゲノミクスのプラットフォームを用いるSARS-CoV-2の迅速な再構築

Rapid reconstruction of SARS-CoV-2 using a synthetic genomics platform

著者 (66件)： THAO Tran Thi Nhu (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  EBERT Nadine (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  V’KOVSKI Philip (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  STALDER Hanspeter (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  PORTMANN Jasmine (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  KELLY Jenna (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  STEINER Silvio (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  HOLWERDA Melle (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  KRATZEL Annika (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  GULTOM Mitra (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  SCHMIED Kimberly (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  LALOLI Laura (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  HUESSER Linda (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  PFAENDER Stephanie (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  HIRT Dagny (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  DIJKMAN Ronald (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  THIEL Volker (Inst. of Virology and Immunology (IVI), Bern, CHE) ,  THAO Tran Thi Nhu (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  LABROUSSAA Fabien (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  EBERT Nadine (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  V’KOVSKI Philip (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  STALDER Hanspeter (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  PORTMANN Jasmine (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  KELLY Jenna (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  STEINER Silvio (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  HOLWERDA Melle (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  KRATZEL Annika (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  GULTOM Mitra (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  SCHMIED Kimberly (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  LALOLI Laura (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  HUESSER Linda (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  PFAENDER Stephanie (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  HIRT Dagny (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  CIPPA Valentina (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  CRESPO-POMAR Silvia (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  DIJKMAN Ronald (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  JORES Joerg (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  THIEL Volker (Dep. of Infectious Diseases and Pathobiology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  THAO Tran Thi Nhu (Graduate School for Biomedical Sci., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  STEINER Silvio (Graduate School for Biomedical Sci., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  HOLWERDA Melle (Graduate School for Biomedical Sci., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  KRATZEL Annika (Graduate School for Biomedical Sci., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  GULTOM Mitra (Graduate School for Biomedical Sci., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  LALOLI Laura (Graduate School for Biomedical Sci., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  LABROUSSAA Fabien (Inst. of Veterinary Bacteriology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  CIPPA Valentina (Inst. of Veterinary Bacteriology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  CRESPO-POMAR Silvia (Inst. of Veterinary Bacteriology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  JORES Joerg (Inst. of Veterinary Bacteriology, Vetsuisse Fac., Univ. Bern, Bern, CHE) ,  HOLWERDA Melle (Insitute for Infectious Diseases, Univ. Bern, Bern, CHE) ,  GULTOM Mitra (Insitute for Infectious Diseases, Univ. Bern, Bern, CHE) ,  LALOLI Laura (Insitute for Infectious Diseases, Univ. Bern, Bern, CHE) ,  WIDER Manon (Insitute for Infectious Diseases, Univ. Bern, Bern, CHE) ,  DIJKMAN Ronald (Insitute for Infectious Diseases, Univ. Bern, Bern, CHE) ,  PFAENDER Stephanie (Dep. for Molecular and Medical Virology, Ruhr-Univ. Bochum, Bochum, DEU) ,  SCHROEDER Simon (Institute of Virology, Charite-Universitaetsmedizin Berlin, corporate member of Freie Universitaet Berlin, Humboldt-Univ. zu Berlin, and Berlin Inst. of Health, Berlin, DEU) ,  MUTH Doreen (Institute of Virology, Charite-Universitaetsmedizin Berlin, corporate member of Freie Universitaet Berlin, Humboldt-Univ. zu Berlin, and Berlin Inst. of Health, Berlin, DEU) ,  NIEMEYER Daniela (Institute of Virology, Charite-Universitaetsmedizin Berlin, corporate member of Freie Universitaet Berlin, Humboldt-Univ. zu Berlin, and Berlin Inst. of Health, Berlin, DEU) ,  CORMAN Victor M. (Institute of Virology, Charite-Universitaetsmedizin Berlin, corporate member of Freie Universitaet Berlin, Humboldt-Univ. zu Berlin, and Berlin Inst. of Health, Berlin, DEU) ,  MUELLER Marcel A. (Institute of Virology, Charite-Universitaetsmedizin Berlin, corporate member of Freie Universitaet Berlin, Humboldt-Univ. zu Berlin, and Berlin Inst. of Health, Berlin, DEU) ,  DROSTEN Christian (Institute of Virology, Charite-Universitaetsmedizin Berlin, corporate member of Freie Universitaet Berlin, Humboldt-Univ. zu Berlin, and Berlin Inst. of Health, Berlin, DEU) ,  MUTH Doreen (German Centre for Infection Res., associated partner Charite, Berlin, DEU) ,  NIEMEYER Daniela (German Centre for Infection Res., associated partner Charite, Berlin, DEU) ,  CORMAN Victor M. (German Centre for Infection Res., associated partner Charite, Berlin, DEU) ,  MUELLER Marcel A. (German Centre for Infection Res., associated partner Charite, Berlin, DEU) ,  DROSTEN Christian (German Centre for Infection Res., associated partner Charite, Berlin, DEU) ,  MUELLER Marcel A. (Martsinovsky Inst. of Medical Parasitology, Tropical and Vector Borne Diseases, Sechenov Univ., Moscow, RUS)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 582  号： 7813  ページ： 561-565  発行年： 2020年06月25日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 逆遺伝学の手法は,ウイルスの発症機序やワクチン開発についての手掛かりを得るのに欠かせないものとなっている。大型RNAウイルスのゲノム,例えばコロナウイルスのゲノムなどは大腸菌(Escherichia coli)でのクローン作製や操作がやりにくいが,これはゲノムのサイズと時折見られる不安定性のためである。従って,RNAウイルスに使える別の迅速かつロバストな逆遺伝学的プラットフォームがあれば,研究に役立つだろう。今回我々は,コロナウイルス科(Coronaviridae),フラビウイルス科(Flaviviridae),ニューモウイルス科(Pneumoviridae)のウイルスなど,さまざまなRNAウイルスを遺伝的に再構築するための全機能を備えた,酵母をベースとする合成ゲノミクスプラットフォームを示す。ウイルス単離株,クローニングされたウイルスDNA,臨床試料あるいは合成DNAを用いて,ウイルスの部分ゲノム断片を作製し,次いでこれらの断片を出芽酵母(Saccharomyces cerevisiae)でTAR(transformation-associated recombination)クローニング法によってワンステップで再構成して,このゲノムを酵母人工染色体として維持した。続いてT7RNAポリメラーゼを用いて,感染性RNAを生成させることで生存可能なウイルスを再構築した。このプラットフォームを用いることで,合成DNA断片を受け取ってからたった1週間で,新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の最近のパンデミック(世界的大流行)を引き起こした重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)の化学合成ウイルスクローンを設計し,作製できた。今回報告した技術的進歩によって,アウトブレイクが起こっている間に,進化するRNAウイルスバリアントをリアルタイムで作製してその機能的な特徴を調べることができるので,新興ウイルスへの迅速な対応が容易になる。Copyright Nature Japan KK 2020

シソーラス用語： 太陽コロナ ,  大腸菌 ,  DNA【核酸】 ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝 ,  酵母 ,  ゲノム ,  RNAウイルス ,  コロナウイルス科 ,  クローン ,  コロナウイルス ,  *ゲノミクス ,  ウイルスゲノム ,  逆遺伝学 ,  クローニング ,  微生物 ,  動物ウイルス

分類 (4件)： ウイルスの形態学,分類学  (EG04020U) ,  ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (4件)： ゲノミクス ,  プラットフォーム ,  SARS-CoV-2 ,  再構築