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J-GLOBAL ID:202002281039132432   整理番号:20A0973257

広範なコケ類,Adeonidae科のゲノム-スキミング系統発生【JST・京大機械翻訳】

A genome-skimmed phylogeny of a widespread bryozoan family, Adeonidae
著者 (15件):
資料名:
巻: 19  号:ページ: 1-10  発行年: 2019年 
JST資料番号: U7052A  ISSN: 1471-2148  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: イギリス (GBR)  言語: 英語 (EN)
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種間の系統発生的関係を理解することは系統的生物学の主要な目標の1つである。同時に,信頼できる系統発生仮説は,形質の進化的歴史を明らかにし,マクロ進化過程をモデル化するための最初の必要条件である。しかしながら,多くの非モデル分類群は,統計的に良く支持された分子系統発生がこれらの目的のために構築できるような程度まで配列決定されていない。ここでは,現在の系統性が形態学的形質に純粋に基づいている,cheilostomes bryozesファミリー,Adeonidae,Busk,1884からの15のミトコンドリアと2つのリボソームオペロン遺伝子の配列情報を抽出するために,ゲノムスキミング法を用いた。Adeonidaeのメンバーは,すべてのchilostomes bryozoans,底生,コロニー,海洋生物のようなものである。Adeonidsは地理的に広く分布し,しばしば局所的に共通しており,時には重要な生息場所である。著者らは,6つの属(Adeona,Adeonellopsis,Bracebridgia,Adeonella,Laminopora,およびCucumlipora)を代表する35のアデノイドコロニーを成功裏にゲノム化した。著者らはまた,16の新しい,循環されたミトコンドリアゲノムについて,以前に報告されたcheilostomes bryozoansの8つにも寄与した。上記のミトコンドリアとリボソーム遺伝子を用いて,これら35試料間の関係を推定した。いくつかの以前の提案とは反対に,Adeonidaeは強く支持された単系統クレードである。しかしながら,属AdeonellaとLamoporaは修正の必要性がある:Adeonellaは多形性で,LaminoporaはいくつかのAdeonella種を持つクレードを形成する。さらに,著者らは,種で99%,属レベルで83%のcox1バーコード領域を用いて,配列クラスタリング同一性を割り当てた。ゲノムスキミングにより得られた配列データを提供し,これはアデノイド内の系統発生的関係の分解能を大きく増加させる。17の遺伝子に基づく高度に支持されたトポロジーを提示し,循環されたcheilostomesミトコンドリアゲノムの利用可能性を実質的に増加させ,著者らが著者らのパイプラインを他のbryozoansにどのように拡張できるかを強調した。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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