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J-GLOBAL ID：202002281172671876   整理番号：20A1424140

タイの上部湾周辺の沿岸地域と地球-ポンドファームからの血液カッスル(Anadara granosa)微生物叢のデータセット【JST・京大機械翻訳】

Dataset of blood cockle (Anadara granosa) microbiota from coastal areas and earthen-pond farms around the upper Gulf of Thailand

著者 (6件)： Theerachat Monnat (Department of Botany, Faculty of Science, Chulalongkorn University, Bangkok 10330, Thailand) ,  Theerachat Monnat (Biofuels by Biocatalysts Research Unit, Faculty of Science, Chulalongkorn University, Bangkok 10330, Thailand) ,  Glinwong Chompunuch (Department of Botany, Faculty of Science, Chulalongkorn University, Bangkok 10330, Thailand) ,  Glinwong Chompunuch (Biofuels by Biocatalysts Research Unit, Faculty of Science, Chulalongkorn University, Bangkok 10330, Thailand) ,  Chulalaksananukul Warawut (Department of Botany, Faculty of Science, Chulalongkorn University, Bangkok 10330, Thailand) ,  Chulalaksananukul Warawut (Biofuels by Biocatalysts Research Unit, Faculty of Science, Chulalongkorn University, Bangkok 10330, Thailand)
資料名： Data in Brief  (Data in Brief)
巻： 30  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3049A  ISSN： 2352-3409  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 二枚貝軟体動物の血液コックル(Anadara granosa)は東南アジアのユニークな海産物である。二枚貝軟体動物はプランクトン上のフィルターフィーダーであり,それらの組織で微生物と重金属を生体内蓄積する。細菌生存は,貝殻内部で生存することにより増強され,その後,二枚貝の摂取後にヒトおよびより高い脊椎動物に感染する。本研究はタイ湾周辺の6農場からのA.granosaに関連する細菌のメタゲノム分析を提示した。3つの農場は海岸に位置し,他の3つは大地池であった。ゲノムDNAをサンプルから抽出し,16S rRNA遺伝子のV3-V4領域の配列決定によって分析し,次に,操作的分類単位の設計のために97%のDNA配列類似性カットオフを用いた。温度,pH,塩分,溶存酸素,および3つの重金属(Cu,Cr,およびHg)の濃度と1つの半金属(As)を含む環境パラメータを研究した。生配列データは,NCBI配列Read Archive登録番号PRJNA592226で利用可能である。Proteobacteria,BacteroidetesおよびCyanobacteriaは,すべての6つの生息場所における微生物叢の共通成分であり,そして,一緒に,すべてのサンプルにおいて相対豊度の77%以上を構成した。これは培養に依存しない方法によるタイの血液コックルにおけるミクロビオームに関する最初の報告である。データは,水産食品の安全性管理を効率的に制御し,改善するために適用できる。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *微生物 ,  細菌 ,  溶存酸素 ,  重金属 ,  軟体動物 ,  ヒト ,  プランクトン ,  塩分 ,  二枚貝類 ,  農場 ,  *ミクロフローラ ,  生息場所 ,  rRNA遺伝子
準シソーラス用語： プロテオバクテリア ,  メタゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 血液カックル ,  二枚貝 ,  軟体動物 ,  Anadara granosa ,  メタゲノミクス ,  16S rRNA遺伝子 ,  重金属

分類 (2件)： 動物性水産食品  (FJ13020C) ,  魚類以外の水産動物  (FH02030V)

タイトルに関連する用語 (8件)： タイ ,  周辺 ,  沿岸地域 ,  地球 ,  血液 ,  Anadara ,  微生物叢 ,  データセット