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J-GLOBAL ID：202002281206843642   整理番号：20A0923162

ハイスループットシークエンシングによる標的形質遺伝子座の迅速位置決めに関する研究【JST・京大機械翻訳】

Rapid Mining Genetic Locus for Controlling Target Traits Using Next-generation Sequencing ( NGS)

著者 (5件)： Lin Jing (河北省農林科学院 粮油作物研究所,国家大豆改良中心石家庄分中心,農業部黄淮海大豆生物学与遺伝育種重点実験室,河北省農作物遺伝育種重点実験室,河北 石家庄 050035;南京農業大学国家大豆改良中心,農業部大豆生物学与遺伝育種重点実験室(綜合),国家作物遺伝与種質資源重点実験室,江蘇 南京 210095) ,  Zhao Qingsong (河北省農林科学院 粮油作物研究所,国家大豆改良中心石家庄分中心,農業部黄淮海大豆生物学与遺伝育種重点実験室,河北省農作物遺伝育種重点実験室,河北 石家庄 050035) ,  Zhang Mengchen (河北省農林科学院 粮油作物研究所,国家大豆改良中心石家庄分中心,農業部黄淮海大豆生物学与遺伝育種重点実験室,河北省農作物遺伝育種重点実験室,河北 石家庄 050035) ,  Yang Chunyan (河北省農林科学院 粮油作物研究所,国家大豆改良中心石家庄分中心,農業部黄淮海大豆生物学与遺伝育種重点実験室,河北省農作物遺伝育種重点実験室,河北 石家庄 050035) ,  Zhao Tuanjie (南京農業大学国家大豆改良中心,農業部大豆生物学与遺伝育種重点実験室(綜合),国家作物遺伝与種質資源重点実験室,江蘇 南京 210095)
資料名： Huabei Nongxuebao  (Huabei Nongxuebao)
巻： 34  号： 6  ページ： 47-53  発行年： 2019年 
JST資料番号： C2462A  ISSN： 1000-7091  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目標性状の遺伝部位を迅速に同定するため、性状と連鎖する分子マーカーを開発し、高世代の選別育成株における不利な性状を選別し、育種のプロセスを加速させる。ダイズMS輪作集団における花色分離のF6株挙動研究材料を用いて、その由来F6を利用した。7つの中20の紫花と17の白花の純合家系はそれぞれ2つのDNA混合プールを構築し、ハイスループット再配列技術で変異情報を獲得し、SNPの濃縮区域を明らかにして、SNPの濃縮区域で分子マーカーを開発して目標性状に対して連鎖分析を行った。その結果、2つのDNAプール間に329992のSNP部位が発見され、混合池間の遺伝的背景は非常に似ているが、明らかなSNP濃縮領域が見られず、おそらく多くの偽陽性部位が存在することが明らかになった。さらに、高品質(Quality>100)のSNP変異部位を選別し、ヘテロ接合SNP部位を除去し、最終的に3371の信頼できる遺伝子座を得た。そのうち、13号の染色上のSNP変異が700個(占める割合は20.77%)であり、2030Mbの物理区間で最大のSNP濃縮領域を形成し、花色を調節するW1遺伝子座がこの区間にある可能性が推測された。この区間内のSNP情報を利用してdCAPS-1、dCAPS-2分子マーカーを開発し、連鎖解析の結果はW1遺伝子座と緊密に連鎖(W1-(0.4cM)-dCAPS-1-(2.3cM)-dCAPS-2)を示した。W1部位はSNPの濃縮領域にあることを示した。以上のように、高世代株の分離群体混合池の構築を通じて、ハイスループットシークエンシング法を用いて、目標性状を制御する遺伝部位を迅速に定位することができ、開発したdCAPSマーカーは不利な性状を有効に除去でき、遺伝育種のプロセスを加速できる。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヘテロ接合 ,  DNA【核酸】 ,  *遺伝 ,  ダイズ ,  染色 ,  位置決め ,  育種 ,  輪作 ,  群体 ,  家系
準シソーラス用語： *配列解析 ,  分子マーカー ,  *ハイスループット ,  連鎖解析 ,  高品質 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (4件)： 標的 ,  形質 ,  遺伝子座 ,  研究