文献

J-GLOBAL ID：202002281288151969   整理番号：20A2389434

水性条件でのN-末端グルタミン酸残基の非酵素的ピログルタミル化機構に関する計算研究【JST・京大機械翻訳】

Computational studies on nonenzymatic pyroglutamylation mechanism of N-terminal glutamic acid residues in aqueous conditions*

著者 (8件)： Nakayoshi Tomoki (Graduate School of Pharmacy, Meijo University, Nagoya, Japan) ,  Nakayoshi Tomoki (Institute of Medical, Pharmaceutical and Health Science, Kanazawa University, Kanazawa, Japan) ,  Kato Koichi (Graduate School of Pharmacy, Meijo University, Nagoya, Japan) ,  Kato Koichi (Department of Pharmacy, Kinjo Gakuin University, Nagoya, Japan) ,  Kurimoto Eiji (Graduate School of Pharmacy, Meijo University, Nagoya, Japan) ,  Oda Akifumi (Graduate School of Pharmacy, Meijo University, Nagoya, Japan) ,  Oda Akifumi (Institute of Medical, Pharmaceutical and Health Science, Kanazawa University, Kanazawa, Japan) ,  Oda Akifumi (Institute for Protein Research, Osaka, Japan)
資料名： Molecular Physics  (Molecular Physics)
巻： 118  号： 14  ページ： e1702727  発行年： 2020年 
JST資料番号： E0336A  ISSN： 0026-8976  CODEN： MOPHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ペプチドおよび蛋白質におけるN末端に位置するグルタミン酸(Glu)残基の自発的環化は,ΔΨピログルタミル化と呼ばれ,いくつかの神経変性疾患に関与すると考えられている。N末端Glu残基が酵素的にピログルタミル化を受けると長い間考えられてきたが,最近,非酵素ピログルタミル化がいくつかのタイプの水性緩衝液中で進行することが実験的に確認された。しかし,詳細な機構は,提案あるいは研究されておらず,いくつかの小分子触媒が,ピログルタミル化に必要かどうかは明らかにされていない。したがって,量子化学計算を用いてN末端Glu残基の3種類のピログルタミル化機構を検討した:触媒が存在しない場合,1つの水分子によって触媒され,2つの水分子によって触媒された。モデル化合物としてC末端上のメチルアミノ基でキャップしたN末端Glu残基を用いて全計算を行った。B3LYP密度汎関数理論を用いて,最適化エネルギー極小と遷移状態形状を得た。ピログルタミル化機構は2段階に大まかに分割される:環化と脱水,および計算した活性化障壁は,それぞれ2と3水支援経路で108と107kJ mol-1であった。計算解析の結果は,水分子がピログルタミル化のための触媒として作用することを示唆する。2水支援ピログルタミル化の計算活性化障壁は108kJ mol-1であり,計算解析の結果は,水分子がピログルタミル化のための触媒として作用することを示した。GRAPHICAL ABSTRACT;Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 最適化 ,  *酵素 ,  ペプチド ,  タンパク質 ,  反応機構 ,  環化反応 ,  水分子 ,  小分子 ,  密度汎関数法 ,  モデル化合物
準シソーラス用語： 神経変性疾患 ,  C末端 ,  量子化学計算 ,  活性化障壁 ,  *残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 非酵素的反応 ,  反応機構 ,  グルタミン酸残基 ,  ピログルタミン酸残基 ,  密度汎関数理論

分類 (3件)： チーズ  (FJ12025C) ,  ペプチド  (CF10080G) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (5件)： N-末端 ,  グルタミン酸残基 ,  酵素 ,  計算 ,  研究