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J-GLOBAL ID：202002281572755206   整理番号：20A0200675

IHI-C2.0:低細胞数からの天然空間クロマチン構成マッピングのための単純なアプローチ【JST・京大機械翻訳】

iHi-C 2.0: A simple approach for mapping native spatial chromatin organisation from low cell numbers

著者 (5件)： Mizi Athanasia (Institute of Pathology, University Medical Center Gottingen, Georg-August University of Gottingen, Robert-Koch-Str. 40, 37075 Gottingen, Germany) ,  Gade Gusmao Eduardo (Institute of Pathology, University Medical Center Gottingen, Georg-August University of Gottingen, Robert-Koch-Str. 40, 37075 Gottingen, Germany) ,  Gade Gusmao Eduardo (Center for Molecular Medicine Cologne, University and University Hospital of Cologne, Robert-Koch-Str. 21, 50931 Cologne, Germany) ,  Papantonis Argyris (Institute of Pathology, University Medical Center Gottingen, Georg-August University of Gottingen, Robert-Koch-Str. 40, 37075 Gottingen, Germany) ,  Papantonis Argyris (Center for Molecular Medicine Cologne, University and University Hospital of Cologne, Robert-Koch-Str. 21, 50931 Cologne, Germany)
資料名： Methods  (Methods)
巻： 170  ページ： 33-37  発行年： 2020年 
JST資料番号： W0241A  ISSN： 1046-2023  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ゲノム構成は,現在,すべてのゲノム機能と密接に関連していると理解されている。このように,3Cに基づくアプローチを介した高次染色体構造の高分解能マッピングは,転写および細胞周期調節,シグナリング効果または疾患開始を研究するための不可欠なツールになっている。それにもかかわらず,3Cベースのプロトコルは,固定条件への依存性,架橋されたクロマチンにおける制限酵素活性,および結紮効率のような警告を伴わない。これらの警告のいくつかに取り組むために,ここでは,化学的固定を必要とせずに,天然の空間的クロマチン接触のゲノム全体の質問を可能にする,流線型iHi-C2.0プロトコルについて述べた。このアプローチは,結紮効率を改善し,最小の材料損失を示し,従って,限界セル数を持つ試料の分析に適している。高スループット配列決定に続いて,iHi-C2.0は,天然条件下で哺乳類染色体内および間の相互作用の高い信号対雑音および焦点マップを生成する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 立体配座 ,  雑音 ,  高分解能 ,  *クロマチン ,  位相幾何学 ,  *細胞計数 ,  染色体 ,  結紮術 ,  ゲノム ,  捕獲 ,  DNA制限酵素 ,  計算機アーキテクチャ ,  相互作用 ,  超並列処理
準シソーラス用語： ゲノム構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 染色体立体配座捕獲 ,  クロマチンループ ,  架橋フリー ,  超並列シークエンシング ,  トポロジー会合ドメイン ,  原子力アーキテクチャ

分類 (4件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  細胞構成体一般  (EF03010Z) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (3件)： 細胞数 ,  クロマチン ,  マッピング