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J-GLOBAL ID：202002281645839559   整理番号：20A0482373

プロセスに基づく種の模倣はより生物学的に関連する種の同定を導く【JST・京大機械翻訳】

Process-based species delimitation leads to identification of more biologically relevant species*

著者 (2件)： Smith Megan L. (Department of Evolution, Ecology, and Organismal Biology, The Ohio State University, Columbus, Ohio, 43210) ,  Carstens Bryan C. (Department of Evolution, Ecology, and Organismal Biology, The Ohio State University, Columbus, Ohio, 43210)
資料名： Evolution  (Evolution)
巻： 74  号： 2  ページ： 216-229  発行年： 2020年 
JST資料番号： C0460A  ISSN： 0014-3820  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： これまでの種に対するほとんどのアプローチは,多様性のみのモデルを考慮してきた。これらのモデルはアロパターン形成に適しているが,遺伝子フロー(例えば,同所性スペシエーションにおいて)のような種形成を駆動する多くの集団レベルプロセスを組み込むことは,生物多様性を生じるプロセスの集団的理解に関する不必要な限界を生じる。これらの過程を考察するために,種の境界を推測する一方で,R-パッケージのdelimitRを導入し,それを適用して網状のテールドロッパスラグ(Prophysaon andersoni)の種境界を同定した。結果は,二次接触がこのシステムにおける重要な機構駆動種であることを示唆した。プロセスを考慮することにより,二次接触駆動スペシエーションのような集団レベルプロセスを考慮し,発散のみを考慮し,陸生スラグにおけるスペシエーションの過程への洞察を得ることができる誤った推論を避けた。さらに,著者らは,3つの公表された経験的データセットに対してdelimitRを適用し,以前の知見を裏付ける結果を見出した。最後に,シミュレーション研究を用いてデdelRの性能を評価し,中程度の数の単一ヌクレオチド多型(SNP;1500)と中程度の発散時間(<10万世代)を持つ3つの個体群について,系統分岐と遺伝子流動を含むモデルを比較した場合,誤差率がゼロに近いことを見出した。著者らが複雑なモデルセット(すなわち,発散,遺伝子フロー,および母集団サイズ変化を含む)に対してデモRを適用するとき,エラー率は中等度(約0.15;10000SNPs)であり,現在のところ,誤分類は非常に類似したモデルの間で起こる。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： スラグ ,  遺伝子 ,  一塩基多型 ,  機械学習 ,  寸法変化 ,  種分化 ,  シミュレーション ,  生物多様性 ,  個体群 ,  生態学 ,  誤り率 ,  *スペシエーション ,  母集団
準シソーラス用語： 陸生 ,  同所性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 生態学的スペシエーション ,  機械学習 ,  補強 ,  スペシエーション ,  種の模倣

分類 (2件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： プロセス ,  種 ,  模倣 ,  生物学 ,  同定