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J-GLOBAL ID：202002281827964702   整理番号：20A2532116

クローンスナップショットから推定される胚性幹細胞の結合分化と分裂【JST・京大機械翻訳】

Coupled differentiation and division of embryonic stem cells inferred from clonal snapshots

著者 (9件)： Ruske Liam J (Rudolf Peierls Centre for Theoretical Physics, University of Oxford, Parks Road, Oxford, OX1 3PU, United Kingdom) ,  Kursawe Jochen (School of Mathematics and Statistics, University of St Andrews, North Haugh, St Andrews KY16 9SS, United Kingdom) ,  Tsakiridis Anestis (Centre for Stem Cell Biology, Department of Biomedical Science, University of Sheffield, Sheffield S10 2TN, United Kingdom) ,  Tsakiridis Anestis (Bateson Centre, University of Sheffield, Sheffield S10 2TN, United Kingdom) ,  Wilson Valerie (Centre for Regenerative Medicine, University of Edinburgh, Edinburgh BioQuarter, 5 Little France Drive, Edinburgh, EH164UU, United Kingdom) ,  Fletcher Alexander G (School of Mathematics and Statistics, University of Sheffield, Hicks Building, Hounsfield Road, Sheffield, S3 7RH, United Kingdom) ,  Fletcher Alexander G (Bateson Centre, University of Sheffield, Sheffield S10 2TN, United Kingdom) ,  Blythe Richard A (SUPA, School of Physics and Astronomy, University of Edinburgh, James Clerk Maxwell Building, Peter Guthrie Tait Road, Edinburgh, EH9 3FD, United Kingdom) ,  Schumacher Linus J (Centre for Regenerative Medicine, University of Edinburgh, Edinburgh BioQuarter, 5 Little France Drive, Edinburgh, EH164UU, United Kingdom)
資料名： Physical Biology  (Physical Biology)
巻： 17  号： 6  ページ： 065009 (19pp)  発行年： 2020年 
JST資料番号： W5573A  ISSN： 1478-3967  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 配列決定,イメージング及びエピジェネティックマーカーにより得られた単一細胞データの欠失は,細胞状態のますます詳細な記述をもたらした。しかし,データがどのように時間的にスナップショットに制限されるので,異なる状態間の細胞移行が,どのように変化するかを同定することは,依然として困難である。このようなスナップショットから細胞状態遷移を与えるための必要条件は,遷移が細胞分裂と共役するかどうかを区別することである。これに取り組むため,良く混合した集団における細胞分裂と分化の2つの最小分岐プロセスモデルを提示する。これらのモデルは,分化と分裂が結合または非共役である動力学を記述する。各モデルに対して,著者らは,各亜集団の平均および分散に対する解析的表現を導出し,尤度に対して,識別および分割事象の完全に観測された軌跡の理想化事例における正確なBayesパラメータ推論およびモデル選択を可能にした。スナップショットの場合,サンプル経路アルゴリズムを提示し,これを用いて実験計画のための測定の最適時間間隔を予測した。次に,この方法論をin vitroデータセットに適用し,自己再生または分化を促進する培養条件におけるエピブラスト幹細胞のクローン増殖をアッセイした。ここで,多数のセル状態は近似Bayes計算を必要とする。両培養条件に対して,著者らの推論は,細胞状態遷移が分裂に結合するモデルを支持する。分化を促進する培養条件では,この分析は動力学における可能なシフトを示し,これらの過程は時間とともにより共役する。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  共役 ,  細胞分裂 ,  *分化 ,  近似法 ,  画像処理 ,  培養条件 ,  *クローン ,  *幹細胞 ,  in vitro実験 ,  細胞移動 ,  *ES細胞 ,  エピジェネティクス
準シソーラス用語： 尤度 ,  単一細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (3件)： 推定 ,  胚性幹細胞 ,  分化