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J-GLOBAL ID：202002281964376160   整理番号：20A2512288

乳癌患者の長期生存予測のための新規プロモーターCpGベース署名【JST・京大機械翻訳】

A Novel Promoter CpG-Based Signature for Long-Term Survival Prediction of Breast Cancer Patients

著者 (5件)： Guo Yang (Department of Breast Surgery, The First Affiliated Hospital of China Medical University, Shenyang, China) ,  Mao Xiaoyun (Department of Breast Surgery, The First Affiliated Hospital of China Medical University, Shenyang, China) ,  Qiao Zhen (Department of Breast Surgery, The First Affiliated Hospital of China Medical University, Shenyang, China) ,  Chen Bo (Department of Breast Surgery, The First Affiliated Hospital of China Medical University, Shenyang, China) ,  Jin Feng (Department of Breast Surgery, The First Affiliated Hospital of China Medical University, Shenyang, China)
資料名： Frontiers in Oncology (Web)  (Frontiers in Oncology (Web))
巻： 10  ページ： 579692  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7089A  ISSN： 2234-943X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNAメチル化は乳癌(BC)の腫瘍形成と発生の間の最も重要な後成的異常の1つとして報告されている。この研究では,BC患者の長期生存予測に対する新しいプロモーターCpGに基づくシグネチャを検討した。訓練セットとして癌ゲノムアトラス(TCGA)データを用い,結果を遺伝子発現Omnibus(GEO)の独立したデータセットで検証した。最初に,異なるメチル化CpG部位をTCGAデータセットでスクリーニングし,その候補プロモーターCpG部位を単変量Cox回帰分析と最小絶対収縮と選択オペレータ回帰分析で予備的に同定した。第2に,署名を段階的回帰分析と多変量Cox比例ハザードモデルで構築し,TCGAとGEOデータベースからそれぞれ2つのコホートの生存分析で検証した。リスクスコアの10年受信者動作特性曲線は,両コホートで0.7以上の曲線下面積を示した。ノモグラムも構築し,放出した。さらに,遺伝子セット濃縮分析を行い,ハイリスク患者におけるより活発な経路を同定した。CpG部位-標的遺伝子相関と差次的メチル化領域をさらに調査した。結論として,プロモーターCpGに基づくシグネチャはBC患者の長期全生存において良好な予後予測効果を示した。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ノモグラム ,  回帰分析 ,  データベース ,  オペレータ ,  メチル化 ,  遺伝子 ,  *プロモーター領域 ,  予後 ,  母集団 ,  遺伝子発現 ,  *乳房腫瘍 ,  腫瘤形成
準シソーラス用語： DNAメチル化 ,  予後予測 ,  *CpG , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： DNAメチル化 ,  乳癌 ,  予後 ,  全生存 ,  署名

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (42件)：

• CoughlinSSEkwuemeDU. Breast cancer as a global health concern. Cancer Epidemiol. (2009) 33:315-8. doi: 10.1016/j.canep.2009.10.00319896917
• BrayFMcCarronPParkinDM. The changing global patterns of female breast cancer incidence and mortality. Breast Cancer Res. (2004) 6:229. doi: 10.1186/bcr93215535852
• FerlayJBrayFPisaniPParkinD. GLOBOCAN 2002. Cancer Incidence, Mortality and Prevalence Worldwide. IARC CancerBase No. 5. version 2.0. New York, NY: Springer (2002).
• FerlayJSoerjomataramIDikshitREserSMathersCRebeloM. Cancer incidence and mortality worldwide: sources, methods and major patterns in GLOBOCAN 2012. Int J Cancer. (2015) 136:E359-86. doi: 10.1002/ijc.2921025220842
• SunLLegoodRdos-Santos-SilvaIGaihaSMSadiqueZ. Global treatment costs of breast cancer by stage: a systematic review. PLoS ONE. (2018) 13:e0207993. doi: 10.1371/journal.pone.020799330475890

タイトルに関連する用語 (8件)： 乳 ,  癌患者 ,  長期 ,  生存 ,  予測 ,  プロモーター ,  CpG ,  署名