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J-GLOBAL ID：202002282221425225   整理番号：20A2765596

勾配ブースティングを用いた一塩基多型と2型糖尿病表現型の関連【JST・京大機械翻訳】

Single Nucleotide Polymorphism and Type 2 Diabetes Mellitus Phenotypes Association Using Gradient Boosting

著者 (4件)： Fadli Aulia (IPB University,Faculty of Mathematics and Natural Science,Department of Computer Science,Bogor,Indonesia) ,  Hasibuan Lailan Sahrina (IPB University,Faculty of Mathematics and Natural Science,Department of Computer Science,Bogor,Indonesia) ,  Kusuma Wisnu Ananta (IPB University,Department of Computer Science and Tropical Biopharmaca Research Center,Bogor,Indonesia) ,  Heryanto Rudi (IPB University,Department of Chemistry and Tropical Biopharmaca Research Center,Bogor,Indonesia)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2020  号： ICACSIS  ページ： 115-120  発行年： 2020年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 精密医学は,個人の遺伝的情報,環境および生活様式に従って疾患治療を提供することを目的とする医療分野である。最近,精密医学研究は糖尿病(DM)のような複雑な疾患の研究に焦点を合わせている。DMの最も一般的な形態は2型DM(T2DM)である。T2DM患者の遺伝情報は,単一ヌクレオチド多型(SNP)とT2DMの表現型の間の関連を見つけることによって得ることができる。本研究は,勾配ブースティング(GB)アルゴリズムを用いて,T2DM表現型に関連すると考えられるSNPを見つけることを目的とする。データは,T2DMの98の蛋白質候補に基づくマウスPhenomeデータベースウェブサイトから採取した。前処理段階を,未使用の特徴と欠測値,SNP符号化,および併合表現型とSNPデータを削除することによって実行した。モデルを,ディシジョンツリーベース学習者と最小二乗損失関数を用いてGBを用いて構築した。GBは0.061の平均MSE値と0.171のMAE値を生成し,T2DMのインシュリン耐性表現型と潜在的に関連する30のSNPを得た。30の選択されたSNPのうちの22は,SNP-蛋白質-表現型関係に基づくマウスゲノム情報ウェブサイト上のT2DM表現型との会合を有することを確認した。Copyright 2020 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  最小二乗法 ,  損失関数 ,  前処理 ,  遺伝 ,  遺伝情報 ,  タンパク質 ,  *糖尿病 ,  *表現型 ,  ライフスタイル ,  *2型糖尿病 ,  インスリン抵抗性 ,  *一塩基多型
準シソーラス用語： *ブースティング ,  ゲノム情報 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 図形・画像処理一般  (JE04010I)

タイトルに関連する用語 (4件)： 勾配ブースティング ,  一塩基多型 ,  2型糖尿病 ,  表現型