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J-GLOBAL ID：202002282479057164   整理番号：20A2512728

マルチオミクスデータと幹細胞性指数のネットワーク解析による神経膠芽腫における癌幹細胞特性の予後予測モデルとバイオマーカーの同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of Prognostic Model and Biomarkers for Cancer Stem Cell Characteristics in Glioblastoma by Network Analysis of Multi-Omics Data and Stemness Indices

著者 (18件)： Du Jianyang (Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Du Jianyang (Translational Medicine Research and Cooperation Center of Northern China, Heilongjiang Academy of Medical Sciences, Harbin, China) ,  Yan Xiuwei (Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Mi Shan (Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Mi Shan (Translational Medicine Research and Cooperation Center of Northern China, Heilongjiang Academy of Medical Sciences, Harbin, China) ,  Li Yuan (Department of Pharmacology (The State-Province Key Laboratories of Biomedicine-Pharmaceutics of China, Key Laboratory of Cardiovascular Research, Ministry of Education), College of Pharmacy, Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Ji Hang (Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Ji Hang (Translational Medicine Research and Cooperation Center of Northern China, Heilongjiang Academy of Medical Sciences, Harbin, China) ,  Hou Kuiyuan (Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Hou Kuiyuan (Translational Medicine Research and Cooperation Center of Northern China, Heilongjiang Academy of Medical Sciences, Harbin, China) ,  Ma Shuai (Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Ba Yixu (Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Ba Yixu (Translational Medicine Research and Cooperation Center of Northern China, Heilongjiang Academy of Medical Sciences, Harbin, China) ,  Zhou Peng (Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Chen Lei (Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Chen Lei (Department of Neurosurgery, The First Affiliated Hospital of Harbin, Harbin, China) ,  Xie Rui (Department of Digestive Internal Medicine, Harbin Medical University Cancer Hospital, Harbin, China) ,  Hu Shaoshan (Department of Neurosurgery, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China)
資料名： Frontiers in Cell and Developmental Biology (Web)  (Frontiers in Cell and Developmental Biology (Web))
巻： 8  ページ： 558961  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7062A  ISSN： 2296-634X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ほとんどのヒト癌の進行は,主に分化した表現型の消失と前駆体および幹細胞様特徴の逐次獲得の段階的蓄積を含む。自己再生と治療抵抗性を特徴とする膠芽腫多形(GBM)幹細胞(GSC)はGBMにおいて重要な役割を担っている。しかし,GBM幹細胞の包括的な理解は不明なままである。2つの幹細胞性指数,mRNAiとEREG-mRNAsiを用いて,GBM幹細胞性を包括的に分析した。mRNAiは,マルチオミクスパラメータ(変異状態,試料タイプ,トランスクリプトミクス,および分子サブタイプなど)と有意に関連していることを観察した。さらに,GBM幹細胞性シグネチャを標的とする潜在的機構と候補化合物を明らかにした。加重遺伝子共発現ネットワーク解析を差分解析と組み合わせることにより,18の幹細胞性関連遺伝子を得,そのうち10は生存と有意に関連していた。さらに,独立した臨床転帰予測因子であるだけでなく,GBMの臨床パラメータを正確に予測することができる2つの独立した癌データベースからの予測モデルを得た。生存分析と実験データは,5つのハブ遺伝子(CHI3L2,FSTL3,RPA3,RRM2,およびYTHDF2)がGBMの予後不良のマーカーとして使用できることを確認した。機構的に,GSCの増殖を阻害する効果は,CD133の比率の減少とGSCの侵襲性の抑制に起因した。in vivo異種移植モデルに基づく結果は,ハブ遺伝子のノックダウンがin vitroでGSCの成長を阻害するという知見と一致する。著者らのアプローチは,臨床腫瘍における癌幹細胞性を定量化するための客観的診断および標的治療ツールの開発を容易にするために適用することができ,腫瘍予後を予測し,新しい幹細胞性関連標的および標的治療を同定し,または標的治療感受性を改善する可能性がある。本研究で同定された5つの遺伝子は,GBM幹細胞治療の標的であることが期待される。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  ヒト ,  表現型 ,  異種移植 ,  *予後 ,  *幹細胞 ,  in vitro実験 ,  *バイオマーカー ,  *膠芽腫 ,  分子標的療法
準シソーラス用語： 予後不良 ,  *予後予測 ,  共発現 ,  CD133抗原 ,  *オミックス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 連結性マップ ,  機械学習法 ,  神経膠芽腫 ,  予後モデル ,  幹細胞性 ,  腫瘍免疫環境

分類 (2件)： 神経系の腫よう  (GN04000V) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

引用文献 (80件)：

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• AzimH. A.Jr.PeccatoriF. A.BroheeS.BranstetterD.LoiS.VialeG. (2015). RANK-ligand (RANKL) expression in young breast cancer patients and during pregnancy. Breast Cancer Res. 17:24. doi: 10.1186/s13058-015-0538-537
• BaoS.WuQ.McLendonR. E.HaoY.ShiQ.HjelmelandA. B. (2006). Glioma stem cells promote radioresistance by preferential activation of the DNA damage response. Nature 444 756-760. doi: 10.1038/nature05236 17051156
• BeckermanP.QiuC.ParkJ.LedoN.KoY. A.ParkA. D. (2017). Human kidney tubule-specific gene expression based dissection of chronic kidney disease traits. EBioMedicine 24 267-276. doi: 10.1016/j.ebiom.2017.09.014 28970079
• BradnerJ. E.HniszD.YoungR. A. (2017). Transcriptional addiction in cancer. Cell 168 629-643. doi: 10.1016/j.cell.2016.12.013 28187285

タイトルに関連する用語 (8件)： マルチオミクス ,  幹細胞 ,  ネットワーク解析 ,  神経膠芽腫 ,  癌幹細胞 ,  予後予測モデル ,  バイオマーカー ,  同定