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J-GLOBAL ID：202002282780857461   整理番号：20A1438828

遺伝子発現プロファイルと腫瘍遺伝子型により特徴づけられる中国の高悪性度漿液性卵巣癌における腫瘍特異的メチローム【JST・京大機械翻訳】

Tumor specific methylome in Chinese high-grade serous ovarian cancer characterized by gene expression profile and tumor genotype

著者 (14件)： Song Fangfang (Department of Epidemiology and Biostatistics, Key Laboratory of Molecular Cancer Epidemiology, Tianjin, Key Laboratory of Cancer Prevention and Therapy, Tianjin, Key Laboratory of Breast Cancer Prevention and Therapy, Ministry of Education, National Clinical Research Center for Cancer, Ti...) ,  Li Lian (Department of Epidemiology and Biostatistics, Key Laboratory of Molecular Cancer Epidemiology, Tianjin, Key Laboratory of Cancer Prevention and Therapy, Tianjin, Key Laboratory of Breast Cancer Prevention and Therapy, Ministry of Education, National Clinical Research Center for Cancer, Ti...) ,  Zhang Baifeng (BGI Genomics, BGI-Shenzhen, Shenzhen 518083, China) ,  Zhao Yanrui (Department of Epidemiology and Biostatistics, Key Laboratory of Molecular Cancer Epidemiology, Tianjin, Key Laboratory of Cancer Prevention and Therapy, Tianjin, Key Laboratory of Breast Cancer Prevention and Therapy, Ministry of Education, National Clinical Research Center for Cancer, Ti...) ,  Zheng Hong (Department of Epidemiology and Biostatistics, Key Laboratory of Molecular Cancer Epidemiology, Tianjin, Key Laboratory of Cancer Prevention and Therapy, Tianjin, Key Laboratory of Breast Cancer Prevention and Therapy, Ministry of Education, National Clinical Research Center for Cancer, Ti...) ,  Yang Meng (Department of Epidemiology and Biostatistics, Key Laboratory of Molecular Cancer Epidemiology, Tianjin, Key Laboratory of Cancer Prevention and Therapy, Tianjin, Key Laboratory of Breast Cancer Prevention and Therapy, Ministry of Education, National Clinical Research Center for Cancer, Ti...) ,  Li Xiangchun (Department of Epidemiology and Biostatistics, Key Laboratory of Molecular Cancer Epidemiology, Tianjin, Key Laboratory of Cancer Prevention and Therapy, Tianjin, Key Laboratory of Breast Cancer Prevention and Therapy, Ministry of Education, National Clinical Research Center for Cancer, Ti...) ,  Tian Jing (Department of Gynecological Oncology, Key Laboratory of Cancer Prevention and Therapy, Tianjin, National Clinical Research Center for Cancer, Tianjin Medical University Cancer Institute and Hospital, Tianjin 300060, China) ,  Huang Caiyun (Department of Epidemiology and Biostatistics, Key Laboratory of Molecular Cancer Epidemiology, Tianjin, Key Laboratory of Cancer Prevention and Therapy, Tianjin, Key Laboratory of Breast Cancer Prevention and Therapy, Ministry of Education, National Clinical Research Center for Cancer, Ti...) ,  Liu Luyang (Department of Epidemiology and Biostatistics, Key Laboratory of Molecular Cancer Epidemiology, Tianjin, Key Laboratory of Cancer Prevention and Therapy, Tianjin, Key Laboratory of Breast Cancer Prevention and Therapy, Ministry of Education, National Clinical Research Center for Cancer, Ti...) ,  Wang Qinghua (Department of Epidemiology and Biostatistics, Key Laboratory of Molecular Cancer Epidemiology, Tianjin, Key Laboratory of Cancer Prevention and Therapy, Tianjin, Key Laboratory of Breast Cancer Prevention and Therapy, Ministry of Education, National Clinical Research Center for Cancer, Ti...) ,  Zhang Wei (Wake Forest Baptist Comprehensive Cancer Center, Wake Forest Baptist Medical Center, Winston-Salem, USA) ,  Zhang Wei (Department of Cancer Biology, Wake Forest School of Medicine, Winston-Salem, USA) ,  Chen Kexin (Department of Epidemiology and Biostatistics, Key Laboratory of Molecular Cancer Epidemiology, Tianjin, Key Laboratory of Cancer Prevention and Therapy, Tianjin, Key Laboratory of Breast Cancer Prevention and Therapy, Ministry of Education, National Clinical Research Center for Cancer, Ti...)
資料名： Gynecologic Oncology  (Gynecologic Oncology)
巻： 158  号： 1  ページ： 178-187  発行年： 2020年 
JST資料番号： E0561C  ISSN： 0090-8258  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 広範な遺伝的および限られたエピジェネティックは,西洋のハイグレード漿液性卵巣癌(HGSOC)の癌ゲノムアトラス(TCGA)によって特性化されてきた。本研究は,ゲノムスケールで中国のHGSOCを特徴づけることを目的とした。著者らは,正常組織に対になった21のHGSOC腫瘍における全ゲノムおよび腫瘍特異的DNAメチル化を調査するために,減少した表現亜硫酸水素配列決定を用い,さらに41のHGSOC患者を含む複製研究が続いた。HGSOCにおける変化したメチル化パターンは,さらに遺伝子発現プロファイルと全エキソーム配列決定データによって特徴づけられた。HGSOC腫瘍を正常組織と比較し,遺伝子プロモーターにおいて,より特異的な過メチル化を認めたが,全体的な低メチル化を観察した。全部で,159,881の異なるメチル化領域(DMRs)と4060の差次的発現遺伝子(DEG)を明らかにした。DNAメチル化とmRNA発現データを統合することにより,それぞれ153の陰性(主に上流領域)と115の陽性(主にCDS領域)DMRs-DEG関連対を同定した。負に相関するDMRs-DEGは,DNAメチル化により破壊された重要な正準経路としてWntと細胞接着分子結合を示した。11のDMRs(CAPS,FZD7,CDKN2A,PON3,KLF4など)を,全体的DNAメチル化マーカーと共に複製サンプルで検証した。全エキソーム配列決定は,TCGAデータセットと比較して,中国のHGSOCにおける比較的少ないTP53突然変異を示した。3レベルオミクスデータの教師なし分析は,腫瘍遺伝学に基づく異なるメチル化と発現サブグループを同定し,その1つはDNAメチル化の増加を示し,TP53変異と有意に関連していた。著者らの個体および統合分析は,中国のHGSOCの組織特異的遺伝的およびDNAメチル化景観に関する詳細に寄与する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： メチル化 ,  RNA【核酸】 ,  *遺伝 ,  *腫瘍 ,  突然変異 ,  ゲノム ,  プロモーター領域 ,  *癌遺伝子 ,  *卵巣腫瘍 ,  エピジェネティクス
準シソーラス用語： DNAメチル化 ,  TP53 ,  過メチル化 ,  差次的遺伝子発現 ,  エクソーム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： HGSOC ,  組織特異的DNAメチル化 ,  統合解析 ,  RNA発現の調節 ,  TP53変異

分類 (1件)： 女性生殖器と胎児の腫よう  (GS04000K)

タイトルに関連する用語 (6件)： 遺伝子発現プロファイル ,  腫瘍遺伝子 ,  中国 ,  悪性度 ,  漿液性卵巣癌 ,  腫瘍