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J-GLOBAL ID：202002282996382146   整理番号：20A1727003

遺伝子-環境相互作用における非蛋白質コード変異の役割を解剖するためのゲノム資源【JST・京大機械翻訳】

Genomic resources for dissecting the role of non-protein coding variation in gene-environment interactions

著者 (3件)： Levings Daniel (Department of Biomedical Sciences, University of Minnesota Medical School, Duluth Campus, 1035 University Drive, Duluth, MN, 55812, USA) ,  Shaw Kirsten E. (Department of Biomedical Sciences, University of Minnesota Medical School, Duluth Campus, 1035 University Drive, Duluth, MN, 55812, USA) ,  Lacher Sarah E. (Department of Biomedical Sciences, University of Minnesota Medical School, Duluth Campus, 1035 University Drive, Duluth, MN, 55812, USA)
資料名： Toxicology  (Toxicology)
巻： 441  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： D0444C  ISSN： 0300-483X  CODEN： TXCYAC  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ゲノムワイド関連研究(GWAS)で同定された単一ヌクレオチド変異体(SNV)の大部分は非蛋白質コードDNA内にあり,遺伝子発現を変化させる可能性がある。非蛋白質コードDNAは転写因子(TF)結合部位として作用するか,またはクロマチンへのDNAの組織化を調節することにより遺伝子発現を制御することができる。非コードDNA配列におけるSNVはTF結合とクロマチン構造を破壊し,これは病理学をもたらす。さらに,環境衛生研究は,生体異物への曝露が全遺伝子ネットワークを調節するTFsの能力を破壊し,病理学をもたらすことを示している。しかし,曝露結合健康結果には大量の個人間変動がある。この不均一性の1つの説明は,遺伝的変異と曝露が遺伝子調節を混乱させ,これが最終的に病気で現れることである。多くの資源は,GWASから共通の変異体を注釈し,それらを保存,機能的ゲノミクス,およびTF結合データと結合する。これらの注釈ツールは,SNVの生物学的意味に関する手がかりを提供し,また,潜在的に破壊された標的遺伝子,エピジェネティックマーカー,経路,および細胞型に関する仮説の生成につながる。まとめると,この情報は,SNVが曝露と疾患リスクに対する個人の応答をどのように変えることができるかを予測するために使用できる。非蛋白質コードDNA内に含まれる調節情報の基本的な理解は,SNVの生物学的結果を予測し,これらのSNVが曝露関連疾患にどのように影響するかを決定するのに必要である。このレビューは,非蛋白質コードゲノムにおける疾患関連遺伝的変異の特性化を助けることが期待される。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *相互作用 ,  DNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  クロマチン ,  *タンパク質 ,  *ゲノム ,  結合部位 ,  遺伝的調節 ,  遺伝子発現 ,  転写因子 ,  アノテーション ,  ゲノムワイド関連解析 ,  エピジェネティクス
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  DNA配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 遺伝子調節 ,  遺伝子発現 ,  非蛋白質コーディングDNA ,  遺伝子-環境相互作用

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (9件)： 遺伝子 ,  環境 ,  相互作用 ,  蛋白質 ,  変異 ,  役割 ,  解剖 ,  ゲノム ,  資源