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J-GLOBAL ID：202002283197932296   整理番号：20A0277035

Hibiscus rosa-sinensis(Malvaceae)の葉緑体ゲノム:変異ホットスポットの比較分析と同定【JST・京大機械翻訳】

Chloroplast genome of Hibiscus rosa-sinensis (Malvaceae): Comparative analyses and identification of mutational hotspots

著者 (7件)： Abdullah (Department of Biochemistry, Quaid-i-Azam University, Islamabad, Pakistan) ,  Mehmood Furrukh (Department of Biochemistry, Quaid-i-Azam University, Islamabad, Pakistan) ,  Shahzadi Iram (Department of Biochemistry, Quaid-i-Azam University, Islamabad, Pakistan) ,  Waseem Shahid (Alpha Genomics Private Limited, Islamabad, Pakistan) ,  Mirza Bushra (Department of Biochemistry, Quaid-i-Azam University, Islamabad, Pakistan) ,  Ahmed Ibrar (Alpha Genomics Private Limited, Islamabad, Pakistan) ,  Waheed Mohammad Tahir (Department of Biochemistry, Quaid-i-Azam University, Islamabad, Pakistan)
資料名： Genomics  (Genomics)
巻： 112  号： 1  ページ： 581-591  発行年： 2020年 
JST資料番号： T0422A  ISSN： 0888-7543  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Hibiscusの系統発生と分類学的不一致を解決するための以前の研究は決定的でなかった。ここでは,Hibiscus rosa-sinensisの葉緑体ゲノム配列を報告する。Hibiscus rosa-sinensis葉緑体ゲノムは160,951bpで,大きい単一コピー(89,509bp)と小さい単一コピー(20,246bp)領域からなり,IRaとIRb(それぞれ25598bp)により分離された。ゲノムは,85の蛋白質コード遺伝子,37の転写RNAおよび8つのリボソームRNAを含む130の遺伝子を含んだ。葉緑体ゲノムの比較分析は,ファミリーMalvaceae内の12種の間で類似の構造を明らかにした。77の蛋白質コード遺伝子の進化率は95%の類似性を示した。コドン使用,アミノ酸頻度,推定RNA編集部位,および反復の分析は,Hibiscus rosa-sinensisとHibiscus syriacusの間にかなりの類似性を示した。Hibiscus属における系統発生的不一致を解決するために,psbZ-trnG,trnK-rps16,trnD-trnY,trnW-trnP,trnS-trnG,trnH-psbA,atpB-rbcL,およびRPL32-TRNLを含む30の変異ホットポットを同定した。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 類似性 ,  RNA【核酸】 ,  *ホットスポット ,  タンパク質 ,  アミノ酸 ,  コドン ,  *フヨウ属 ,  RNAエディティング ,  *ゲノム ,  rRNA ,  系統発生 ,  遺伝子
準シソーラス用語： 分類学 ,  *葉緑体ゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Malvaceae ,  Hibiscus ,  反復 ,  分類学的不一致 ,  進化率 ,  系統学

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： Hibiscus ,  Rosa ,  葉緑体ゲノム ,  変異 ,  ホットスポット ,  比較分析 ,  同定