文献

J-GLOBAL ID：202002283250414468   整理番号：20A1966181

貴州地方におけるニワトリIL8RB遺伝子多型と肉品質への影響【JST・京大機械翻訳】

Polymorphism of the IL8RB gene in 3 Guizhou local chicken and its effect on meat quality

著者 (8件)： Wu Lei (貴州大学高原山地動物遺伝育種与繁殖教育部重点実験室,貴州 貴陽550025;貴州大学貴州省動物遺伝育種与繁殖重点実験室,貴州 貴陽550025;貴州大学動物科学学院,貴州 貴陽550025) ,  Tan Yuanyu (貴州大学高原山地動物遺伝育種与繁殖教育部重点実験室,貴州 貴陽550025;貴州大学貴州省動物遺伝育種与繁殖重点実験室,貴州 貴陽550025;貴州大学動物科学学院,貴州 貴陽550025) ,  Tan Guanghui (貴州大学高原山地動物遺伝育種与繁殖教育部重点実験室,貴州 貴陽550025;貴州大学貴州省動物遺伝育種与繁殖重点実験室,貴州 貴陽550025;貴州大学動物科学学院,貴州 貴陽550025) ,  Li Jiezhang (貴州大学高原山地動物遺伝育種与繁殖教育部重点実験室,貴州 貴陽550025;貴州大学貴州省動物遺伝育種与繁殖重点実験室,貴州 貴陽550025;貴州大学動物科学学院,貴州 貴陽550025) ,  Zhang Yiyu (貴州大学高原山地動物遺伝育種与繁殖教育部重点実験室,貴州 貴陽550025;貴州大学貴州省動物遺伝育種与繁殖重点実験室,貴州 貴陽550025;貴州大学動物科学学院,貴州 貴陽550025) ,  Jiang Huimei (畢節市畜禽遺伝資源管理站,貴州 畢節,551700) ,  Yang Yuanqing (畢節市畜禽遺伝資源管理站,貴州 畢節,551700) ,  Xiang Chengju (畢節市畜禽遺伝資源管理站,貴州 畢節,551700)
資料名： Fujian Nonglin Daxue Xuebao. Ziran Kexue Ban  (Fujian Nonglin Daxue Xuebao. Ziran Kexue Ban)
巻： 49  号： 4  ページ： 512-518  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2897A  ISSN： 1671-5470  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： IL8RB遺伝子の一塩基多型(SNP)部位を発掘するため、長順緑殻卵鶏、黔画烏鶏と威寧鶏を材料とし、PCR産物直接シークエンシング法によりIL8RB遺伝子に対してSNPスクリーニングを行い、突然変異前後の配列に対してバイオインフォマティクス分析を行った。結果は以下を示した。3つのニワトリのIL8RB遺伝子において、2つのミスセンス突然変異部位が検出され、g.22589443C>T突然変異は3種類の遺伝子型を産生し、中度の多型であり、ロイシンがセリンになる。g.22589512C>T突然変異は2種類の遺伝子型を産生し、低度多型であり、トレオニンはメチオニンに変わった。カイ二乗(χ2)の結果は,以下を示した。G.22589443C>T遺伝子座の遺伝子型分布は,Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)より著しく高かった。Har-dy-Weinberg平衡(P<0.05)は,貴州の烏鶏と威寧鶏の個体群の遺伝子型分布において,有意に逸脱した。g.22589512C>T突然変異部位は3つのニワトリの遺伝子型分布がHardy-Weinberg平衡から逸脱しなかった(P>0.05)。連鎖不平衡分析結果は以下のことを示した。3つのニワトリ集団のIL8RB遺伝子の2つのSNP部位の間に強い連鎖不平衡が存在しなかった。2つのSNP部位は3種類のハプロタイプと4種類の二倍型を産生し、ハプロタイプH1と二倍型H1の出現頻度が最も高く、ハプロタイプH3と二倍型H2の出現頻度が最も低かった。バイオインフォマティクス分析によると、3種類のハプロタイプの自由エネルギーは:TC>CTであり、安定性は:CT>CC>TCであり、2つのSNP部位はアミノ酸の変化を引き起こすが、タンパク質の二次構造と三次構造変化を引き起こさなかった。IL8RB遺伝子変異と黔画烏鶏肉品質相関性分析により、二倍型H1個体の肉色指標はH1H3個体より明らかに高く(P<0.05)、その他の各SNP部位及び二倍型は各指標間の差異が著しいレベルに達しなかった(P>0.05)。検出された2つのSNP部位は鶏肉の品質遺伝マーカーを改善する可能性があり、今後の研究にデータ参考と理論支持を提供する。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アミノ酸 ,  *遺伝子 ,  遺伝子型 ,  鶏肉 ,  突然変異 ,  二次構造 ,  スクリーニング ,  ハプロタイプ ,  ミスセンス突然変異 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  分枝鎖アミノ酸 ,  脂肪族アルコール ,  アミノアルコール ,  ヒドロキシ酸 ,  スルフィド ,  含硫アミノ酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： 配列解析 ,  連鎖不平衡 ,  バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 鶏  (FD03020F) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

物質索引 (3件)： ロイシン ,  セリン ,  メチオニン

タイトルに関連する用語 (4件)： 地方 ,  ニワトリ ,  多型 ,  肉