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J-GLOBAL ID：202002283390201512   整理番号：20A1896933

マングローブ由来Streptomyces sp.HM190の流線ゲノム解読による3つの22員マクロライドの発見【JST・京大機械翻訳】

Discovery of Three 22-Membered Macrolides by Deciphering the Streamlined Genome of Mangrove-Derived Streptomyces sp. HM190

著者 (11件)： Ye Yanghui (Ocean College, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Anwar Nusratgul (College of Life Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Mao Xuming (College of Life Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Wu Shihua (College of Life Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Yan Cen (Ocean College, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Zhao Zhe (College of Life Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Zhang Ran (College of Life Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Nie Yanfang (College of Life Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Zhang Jianwei (Cardiovascular Health Department, AstraZeneca Trading Co., Ltd., Wuxi, China) ,  Wang Jidong (Key Laboratory of Vector Biology and Pathogen Control of Zhejiang Province, College of Life Science, Huzhou University, Huzhou, China) ,  Wu Min (Ocean College, Zhejiang University, Hangzhou, China)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 11  ページ： 1464  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 中国,Fugong村のマングローブKandelia obovataの根圏土壌から,中程度の好塩菌であるHM190株を分離した。16SリボソームRNA(rRNA)遺伝子配列と系統発生分析の結果は,菌株HM190がStreptomyces属に属し,Streptomyces heilongensis NEAU-W2Tに対する99.79%の最も高い配列類似性を持つことを明らかにした。菌株HM190の完全なゲノムは,71.97%のG+C含有量を有する線状染色体において7,762,826bpから成った。抗SMASH分析により,合計30生合成遺伝子クラスター(BGC)が二次代謝に関与すると予測され,その内の12はポリケチド及び非リボソームペプチド由来二次代謝産物の産生に関与した。遺伝子クラスター5は,左腕領域に属する株特異的126,331-bpゲノムアイランドにおけるマクロライド生合成の原因であった。組合せゲノミクス-メタボロミクス解析は,3つの22員環マクロライド(化合物1~3)の発見をもたらした。それらの構造を高分解能エレクトロスプレーイオン化質量分析(HRESIMS)と核磁気共鳴(NMR)を含む分光技術を用いて解明した。化合物1~3の絶対配置をX線単結晶回折とNMRデータ解析により決定した。3つの化合物は,腫瘍細胞系HepG2,A549およびHCT116に対して中程度の細胞毒性活性を示した。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： NMR【磁気共鳴】 ,  生合成 ,  絶対配置 ,  rRNA ,  *ゲノム ,  *Streptomyces ,  好塩菌 ,  *マングローブ ,  二次代謝産物 ,  A549細胞
準シソーラス用語： *マクロライド ,  ゲノミクス ,  メタボロミクス ,  遺伝子クラスタ ,  二次代謝 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Streptomyces sp.HM190 ,  生合成遺伝子クラスター ,  22員マクロライド ,  構造解明 ,  細胞毒性活性

分類 (1件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

引用文献 (57件)：

• Akira H., Hideki O., Toshitaka K., Mitsuru N., Hiroshi H., Akira I. (1989). Structure of kaimonolide A, a novel macrolide plant growth inhibitor from a Streptomyces strain. Agr. Biol. Chem. 53 2831-2833. doi: 10.1271/bbb1961.53.2831
• Alfredo B., Sarmiento V. A., Miguel O., Pérez V. I., Martín J., Nuria D. P., et al (2017). Lobophorin K, a new natural product with cytotoxic activity produced by Streptomyces sp. M-207 associated with the deep-sea coral Lophelia pertusa. Mar. Drugs 15:144. doi: 10.3390/md15050144
• Altschul S. F., Madden T. L., Schaffer A. A., Zhang J., Lipman D. J. (1997). Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Res. 25 3389-3402. doi: 10.1093/nar/25.17.3389
• Anzai Y., Kim H., Park J. Y., Wakabayashi H., Oyaizu H. (2000). Phylogenetic affiliation of the Pseudomonads based on 16s rRNA sequence. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 1563-1589. doi: 10.1099/00207713-50-4-1563
• Becerril A., Alvarez S., Brana A. F., Rico S., Diaz M., Santamaria R. I., et al (2018). Uncovering production of specialized metabolites by Streptomyces argillaceus: activation of cryptic biosynthesis gene clusters using nutritional and genetic approaches. PLoS One 13:e0198145. doi: 10.1371/journal.pone.0198145

タイトルに関連する用語 (6件)： マングローブ ,  Streptomyces ,  流線 ,  ゲノム解読 ,  マクロライド ,  発見