文献

J-GLOBAL ID：202002283488194113   整理番号：20A1798626

クラウドにおける蛋白質二次構造解析【JST・京大機械翻訳】

Protein Secondary Structure Analysis in the Cloud

著者 (2件)： Ferretti Marco (Department of Electrical, Computer and Biomedical Engineering, University of Pavia, Italy) ,  Santangelo Luigi (Department of Electrical, Computer and Biomedical Engineering, University of Pavia, Italy)
資料名： ACM Proceedings  (ACM Proceedings)
号： PBio 2018  ページ： 63-70  発行年： 2018年 
JST資料番号： D0698C  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くの生物学的問題,例えば,蛋白質対の二次構造における幾何学的パターンの再発生は,それらの強力なアーキテクチャと多数のCPUのおかげで,HPCシステム上で走る並列アプリケーションを用いてしばしば解決され,良好な性能が得られる。最近,クラウドコンピューティングは,ある種の並列アプリケーションを展開するための便利な環境として浮上している。本研究では,事前のクラスタとHPCシステムに関して並列に実行され,クラウド環境におけるそのポーリングを研究するアプリケーションであるクロスモチフ探索を調べた。本研究では,通信オーバヘッドを予測するために,プロファイリングと解析モデリングを用いた。プロファイリングは信頼できない推定値を与えるが,モデルベースの予測と実際のデータは,応用に埋め込まれた通信の単純なパターンのおかげで,良好な整合である。全体として,クロスモチフ探索はクラウドにおける実行可能な実装を有する。Please refer to this article’s citation page on the publisher website for specific rights information. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *タンパク質 ,  ポーリング ,  *二次構造 ,  クラスタ ,  応用プログラム ,  推定量 ,  計算機アーキテクチャ
準シソーラス用語： モデルベース ,  通信オーバーヘッド ,  クラウドコンピューティング ,  プロファイリング ,  クラウド開発環境 ,  並列アプリケーション , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： クラウドインフラストラクチャー ,  HPC ,  並列アーキテクチャ ,  性能予測 ,  蛋白質二次構造

分類 (2件)： 計算機網  (JC03000K) ,  その他の情報処理  (JE15050M)

タイトルに関連する用語 (3件)： クラウド ,  蛋白質二次構造 ,  解析