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J-GLOBAL ID：202002284701850908   整理番号：20A1126719

未成熟トウモロコシ胚のカルス誘導における選択的スプライシングの包括的プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Global Profiling of Alternative Splicing in Callus Induction of Immature Maize Embryo

著者 (11件)： Du Xuemei (Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Fang Ting (Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Liu Yan (Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Huang Liying (College of Agronomy and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing, China) ,  Wang Xiaoli (Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Zhang Jie (College of Agronomy and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing, China) ,  Cui Yangbo (College of Agronomy and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing, China) ,  Zang Maosen (College of Agronomy and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing, China) ,  Wang Guoying (Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Fu Junjie (Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Liu Yunjun (Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China)
資料名： In Vitro Cellular & Developmental Biology-Plant  (In Vitro Cellular & Developmental Biology-Plant)
巻： 56  号： 2  ページ： 159-168  発行年： 2020年 
JST資料番号： W0380A  ISSN： 1054-5476  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 植物におけるカルス誘導は,動物における多能性幹細胞誘導と類似しており,遺伝子発現における全体的変化を招くことができる。代替スプライシングは,動物における多能性幹細胞の誘導における機能的複雑性と機能の基礎となる重要な因子であると考えられている。しかしながら,植物カルス誘導における代替スプライシングの役割は不明のままである。著者らは,異なる段階でカルス誘導培地(CIM)上に誘導されたトウモロコシカルスの高スループットRNA配列を行い,全体的な選択的スプライシング変化を記録した。各段階において,20,000以上の選択的スプライシング事象が検出され,数はカルス誘導によりわずかに増加した。全体で,648から2580の遺伝子は,スプライセオソーム,代謝経路,およびmRNAサーベイランス経路に属するカルス誘導の間に有意な選択的スプライシング変化を示すことがわかった。また,選択的スプライシングは,カルス誘導に寄与するために,転写調節に沿って機能することができることがわかった。特に,Arabidopsisにおけるオーソログ遺伝子がカルス誘導の第一段階細胞運命遷移において重要な役割を果たすZmWOX11は,カルス誘導時に選択的スプライシングおよび発現レベル変化を示すことが見出された。著者らの結果は,研究者がトウモロコシにおけるカルス誘導の分子機構,特に選択的スプライシングレベルをさらに探究できる基礎を確立する。Copyright The Society for In Vitro Biology 2019 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 動物 ,  RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  代謝経路 ,  *カルス ,  *カルス培養 ,  Arabidopsis ,  スプライセオソーム ,  *選択的スプライシング ,  多能性幹細胞
準シソーラス用語： 分子機構 ,  ハイスループット ,  細胞運命 ,  転写調節 ,  ナンセンス変異依存mRNA分解 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： トウモロコシ ,  カルス誘導 ,  RNA-seq ,  選択的スプライシング ,  WOx

分類 (3件)： し好料作物  (FC03076D) ,  薬用植物  (FC03075M) ,  豆類  (FC03035U)

タイトルに関連する用語 (6件)： 成熟 ,  トウモロコシ ,  胚 ,  カルス誘導 ,  選択的スプライシング ,  プロファイリング