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J-GLOBAL ID：202002284985370721   整理番号：20A2795310

尿路上皮癌分類サブタイプの特異的遺伝的感受性パターン【JST・京大機械翻訳】

Specific genetic susceptibility patterns of the urothelial bladder cancer taxonomic subtypes

著者 (3件)： Benitez R (Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), Madrid, Spain) ,  Pineda S (Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), Madrid, Spain) ,  Malats N (Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), Madrid, Spain)
資料名： Urologic Oncology: Seminars and Original Investigations  (Urologic Oncology: Seminars and Original Investigations)
巻： 38  号： 12  ページ： 897  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3220A  ISSN： 1078-1439  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 尿路上皮膀胱癌(UBC)は,その発生に関与する多様な遺伝的および環境要因を有する複雑な疾患である。UBCが不均一な疾患であり,分子サブタイプが特性化されていることを示した。UBC分類学的サブタイプに従ってUBC遺伝的感受性パターンを同定することを目的とした。対象は,SBC/EPICURO症例対照試験から得た。パラフィン包埋を用いて,KRT5/6,KRT14,FOXA1およびGATA3の免疫組織化学的蛋白質発現を評価した。連鎖方程式による多重帰属を用いて欠測値を置換した。マーカー迅速スコアを測定し,UBCサブタイプを定義するために教師なし階層的クラスタに用いた。ゲノムDNAを白血球から抽出し,Illumina HumanHap1Mアレイで遺伝子型を決定した。著者らは,品質管理フィルタを通過した350,084のSNPを有する多項ロジスティックENETを適用することにより,サブタイプと遺伝的変異の間の関連を分析した。各サブタイプと特異的に関連するSNPを,FUMA GWASプラットフォームを用いて蛋白質コード遺伝子およびGO生物学的過程として注釈した。症例の3つの有意なクラスタを同定した:BASQ様(8%),Luminal様(64%)および混合(28%)。ENETは,UBCサブタイプと特異的に関連した28888のSNP,BASQ様腫瘍に関連する274のSNP,および主にGO脂質ヒドロキシル化過程に注釈付けされた。Luminal様腫瘍と関連した1654のSNPは,タバコ化合物代謝に関与するフェノールを含む化合物代謝過程を含む24の異なるGO生物学的過程に注釈付けされた。混合腫瘍と関連する960のSNPは,GO角化過程に注釈付けされた。著者らの結果は,各UBCサブタイプに対する特異的遺伝的感受性背景を指摘する。人工知能アプローチ(ENET)は膀胱癌病因の描写とより良い理解に役立つ。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 品質管理 ,  タバコ ,  *遺伝 ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  脂質 ,  腫瘍 ,  タンパク質 ,  ヒドロキシ化 ,  クラスタ ,  膀胱腫瘍 ,  病因 ,  免疫組織化学 ,  ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： ゲノムDNA , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 泌尿生殖器の腫よう  (GM04000S) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  消化器の腫よう  (GH04000D)

タイトルに関連する用語 (5件)： 尿路上皮癌 ,  分類 ,  サブ ,  タイプ ,  遺伝的感受性