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J-GLOBAL ID：202002285104469193   整理番号：20A1082887

転写関連哺乳類クロマチン折畳みの3D景観の解明【JST・京大機械翻訳】

Resolving the 3D Landscape of Transcription-Linked Mammalian Chromatin Folding

著者 (27件)： Hsieh Tsung-Han S. (Department of Molecular and Cell Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Hsieh Tsung-Han S. (Li Ka Shing Center for Biomedical and Health Sciences, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Hsieh Tsung-Han S. (CIRM Center of Excellence, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Hsieh Tsung-Han S. (Center for Computational Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Hsieh Tsung-Han S. (Howard Hughes Medical Institute, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Cattoglio Claudia (Department of Molecular and Cell Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Cattoglio Claudia (Li Ka Shing Center for Biomedical and Health Sciences, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Cattoglio Claudia (CIRM Center of Excellence, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Cattoglio Claudia (Howard Hughes Medical Institute, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Slobodyanyuk Elena (Department of Molecular and Cell Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Slobodyanyuk Elena (Li Ka Shing Center for Biomedical and Health Sciences, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Slobodyanyuk Elena (CIRM Center of Excellence, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Slobodyanyuk Elena (Howard Hughes Medical Institute, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Hansen Anders S. (Department of Molecular and Cell Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Hansen Anders S. (Li Ka Shing Center for Biomedical and Health Sciences, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Hansen Anders S. (CIRM Center of Excellence, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Hansen Anders S. (Howard Hughes Medical Institute, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Hansen Anders S. (Department of Biological Engineering, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA 02142, USA) ,  Rando Oliver J. (Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01605, USA) ,  Tjian Robert (Department of Molecular and Cell Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Tjian Robert (Li Ka Shing Center for Biomedical and Health Sciences, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Tjian Robert (CIRM Center of Excellence, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Tjian Robert (Howard Hughes Medical Institute, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Darzacq Xavier (Department of Molecular and Cell Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Darzacq Xavier (Li Ka Shing Center for Biomedical and Health Sciences, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Darzacq Xavier (CIRM Center of Excellence, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Darzacq Xavier (Center for Computational Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, CA 94720, USA)
資料名： Molecular Cell  (Molecular Cell)
巻： 78  号： 3  ページ： 539-553.e8  発行年： 2020年 
JST資料番号： W1167A  ISSN： 1097-2765  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： エピゲノムコンパートメントおよびトポロジー的に会合するドメイン(TAD)の大規模におけるゲノムの折畳みは,現在,比較的良く理解されているが,クロマチンがより細かいスケールで折畳まれているかは,哺乳類ではほとんど解明されていない。ここでは,マウス幹細胞における3Dゲノム組織化と転写調節の間のリンクをプローブするために,高分解能マイクロCを用いることにより,従来の3Cベースの方法のいくつかの限界を克服した。転写因子,補因子及びクロマチン修飾因子の組合せ結合は,プロモーター(P-P)又はエンハンサー-プロモーター(E-P)及びポリコーム領域間の束接触を結びつけるストライプ,ドット及びドメインを含む異なる調節特徴を持つTAD領域を空間的に分離する。ドメインの端部から伸長するE-Pストライプは,しばしばCTCFとcoheシンの占有がない場合に,共発現した遺伝子座を主にリンクしている。転写の急性阻害は,高次クロマチン構造を変化させることなく,これらの遺伝子関連折畳み特徴を破壊する。著者らの研究は,クロマチン折畳みと遺伝子調節の間の機能的リンクを確立する,以前に不明瞭なファインスケールゲノム構成を明らかにしていない。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 位相幾何学 ,  *クロマチン ,  *哺乳類 ,  *折畳み ,  ゲノム ,  遺伝的調節 ,  プロモーター領域 ,  *三次元 ,  幹細胞 ,  転写因子 ,  補因子
準シソーラス用語： ドメイン構造 ,  共発現 ,  転写調節 ,  エピゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： マイクロ-C ,  エンハンサー-プロモーター(E-P)相互作用 ,  3Dゲノム ,  TAD ,  転写 ,  POL II ,  CTCF ,  ループ押出 ,  30nmクロマチン繊維

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： 転写 ,  哺乳類 ,  クロマチン ,  折畳み ,  3D ,  景観