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J-GLOBAL ID：202002285279992912   整理番号：20A0973341

トランスクリプトーム解析は,高地植物種,Primula sikkimensisにおける環境合図による遺伝子調節の可塑性を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome analysis reveals plasticity in gene regulation due to environmental cues in Primula sikkimensis , a high altitude plant species

著者 (8件)： Gurung Priya Darshini (National Center for Biological Sciences (NCBS), Tata Institute of Fundamental Research, Bengaluru, India) ,  Gurung Priya Darshini (Manipal University, Manipal, India) ,  Upadhyay Atul Kumar (National Center for Biological Sciences (NCBS), Tata Institute of Fundamental Research, Bengaluru, India) ,  Upadhyay Atul Kumar (Present Address: Thapar Institute of Engineering & Technology, Department of Biotechnology, Patiala, India) ,  Bhardwaj Pardeep Kumar (Institute of Bioresource & Sustainable Development, A National Institute under Department of Biotechnology, Ministry of Science & Technology, Government of India, Gangtok, India) ,  Bhardwaj Pardeep Kumar (Present address: Institute of Bioresources and Sustainable Development, Upper Shillong, India) ,  Sowdhamini Ramanathan (National Center for Biological Sciences (NCBS), Tata Institute of Fundamental Research, Bengaluru, India) ,  Ramakrishnan Uma (National Center for Biological Sciences (NCBS), Tata Institute of Fundamental Research, Bengaluru, India)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 20  号： 1  ページ： 1-12  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 自然系における遺伝子発現における可塑性の研究は,植物種に及ぼす気候変動の影響を予測し,管理するために重要である。ヒマラヤ植物(Primula sikkimensis)における非生物的ストレス補償に対する遺伝子発現レベル変化の寄与を理解するために,(Ambient)内での移植実験を行い,(Below Ambient and Above Ambient)種の高度範囲限界を超えた。著者らは,Illina塩基配列決定技術を用いて,9つのトランスクリプトーム(各々の高度範囲条件から3つ)を配列した。著者らは,3つの移植条件の間で移植の適応性変化を比較した。環境に対する環境(109)と環境に対する環境(85)の間の有意に差次的に発現した遺伝子(DEG)の多数が同定された。植物成長と発生に関与する転写物は,環境条件下でほとんどアップレギュレートされた。シグナル伝達,防御および膜輸送に関与する転写物は,上記の環境条件でほとんどアップレギュレートされた。経路分析により,代謝過程,二次代謝及びフラボノイド生合成に関与する遺伝子の大部分は環境条件下で異なって発現し,一方,光合成及び植物ホルモンシグナル伝達に関与する遺伝子の大部分は上記の環境条件で異なって発現することを明らかにした。加えて,著者らは,上記の環境条件と比較して,環境条件下での移植個体において,より高い生殖適応性を観察した。低温適応性P.sikkimensis植物から期待されるものとは反対に。形態学的および生活史特性で観察される表現型可塑性を促進する可能性があるトランスクリプトーム変化を通して,気候変化への急速な適応のためのP.sikkimensisの能力を明らかにした。同定された遺伝子および経路は,それらの自然環境におけるP.sikkimensisの温度ストレス(高温および寒冷ストレス)耐性機構を理解するための遺伝的資源を提供する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *塑性 ,  低温 ,  *遺伝 ,  *遺伝子 ,  光合成 ,  生殖 ,  ヌクレオチド配列 ,  植物成長 ,  気候変動 ,  フラボノイド ,  寒冷ストレス ,  遺伝子発現 ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 環境条件 ,  非生物的ストレス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 遺伝子発現 ,  移植実験 ,  トランスクリプトーム ,  気候変動 ,  範囲限界

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物に対する影響  (EE04030Z)

引用文献 (78件)：

• Annu Rev Ecol Syst; The geographic range: size,shape, boundaries, and internal structure; JH Brown, GC Stevens, DM Kaufman; 27; 1996; 597-623; 10.1146/annurev.ecolsys.27.1.597; citation_id=CR1
• Proc R Soc B Biol Sci; Geographic range limits: achieving synthesis; KJ Gaston; 276; 2009; 1395-1406; 10.1098/rspb.2008.1480; citation_id=CR2
• Anthr Rev; The Anthropocene equation; O Gaffney, W Steffen; 4; 2017; 53-61; citation_id=CR3
• Adv Genet; Evolutionary significance of phenotypic plasticity in plants; AD Bradshaw; 13; 1965; 115-155; 10.1016/S0065-2660(08)60048-6; citation_id=CR4
• Heredity.; Rethinking phenotypic plasticity and its consequences for individuals, populatins and species; A Forsmsn; 115; 2015; 276-284; 10.1038/hdy.2014.92; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (8件)： トランスクリプトーム解析 ,  高地 ,  植物種 ,  Primula ,  環境 ,  合図 ,  遺伝子調節 ,  可塑性