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J-GLOBAL ID：202002285457541964   整理番号：20A2520317

IGS rRNA領域の解析及びLeishmania(V.)braziliensis特性化への適用性【JST・京大機械翻訳】

Analysis of the IGS rRNA Region and Applicability for Leishmania (V.) braziliensis Characterization

著者 (6件)： de Goes Tayna C. (Aggeu Magalhaes Institute, Av. Moraes Rego, Cidade Universitaria, 50670-420 Recife, PE, Brazil) ,  de Morais Rayana C. S. (Aggeu Magalhaes Institute, Av. Moraes Rego, Cidade Universitaria, 50670-420 Recife, PE, Brazil) ,  de Melo Maria G. N. (Aggeu Magalhaes Institute, Av. Moraes Rego, Cidade Universitaria, 50670-420 Recife, PE, Brazil) ,  e Silva Romulo P. (Aggeu Magalhaes Institute, Av. Moraes Rego, Cidade Universitaria, 50670-420 Recife, PE, Brazil) ,  Rezende Antonio M. (Aggeu Magalhaes Institute, Av. Moraes Rego, Cidade Universitaria, 50670-420 Recife, PE, Brazil) ,  de Paiva-Cavalcanti Milena (Aggeu Magalhaes Institute, Av. Moraes Rego, Cidade Universitaria, 50670-420 Recife, PE, Brazil)
資料名： Journal of Parasitology Research (Web)  (Journal of Parasitology Research (Web))
巻： 2020  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7785A  ISSN： 2090-0023  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 原因種はアメリカ皮膚リーシュマニア症(ACL)の進化に影響する重要な因子である。風土病地域におけるその広い分布のため,Leishmania(V.)braziliensisはブラジルの循環における最も重要な種の1つと考えられている。リボソームRNA(rRNA)由来の分子標的を用いてLeishmania spp.を同定した。しかし,遺伝子間スペーサー(IGS)領域は,寄生虫種分化においてまだ調査されていない。そのうえ,この領域のために公共リポジトリに堆積したシーケンスの不足がある。このように,異なるLeishmania spp.からのIGS rRNA領域の配列を分析し,提供し,L.braziliensisを特性化するバイオマーカーとしてのそれらの可能性を評価した。Leishmania spp.PCR産物のIGS rRNA領域の完全な増幅のためにプライマーセットを設計し,サンガー配列決定に供した。得られた配列を配列し,サイズと類似性,ならびにGenBankに沈着させた。IGS rRNAに存在する反復要素(IGSRE)の特性も検証した。さらに,qPCRのためのL.braziliensis同定のためのプライマーセットを開発し,最適化した。感度(S),特異性([数式:原文を参照])および効率([数式:原文を参照])試験を適用した。IGS rRNA領域の平均サイズは3kbであり,得られた配列の類似性解析は種間で高い保存を示した。IGSRE反復領域のサイズは61と71bpの間で変化し,いくつかの種の間には高い同一性があることが観察された。9つの異なる種のIGS rRNA部分領域に対して発生した15の配列は,これまでGenBankに沈着した。L.braziliensisのための特異的プライマーシステムは,Leishmania naiffiのための[数式:原文を参照],および[数式:原文を参照]を示した。Leishmania guyensisの[数式:原文を参照];およびLeishmania shawiのための[数式:原文を参照]。このプロトコルシステムは,患者の寄生虫負荷の診断,同定,および定量に使用可能であり,この病因薬剤による感染症例に対するより適切な治療管理の方向を援助する。それ以外に,データベースに沈着した未発表シーケンスは,異なる文脈における多重解析に使用できる。Copyright 2020 Tayna C. de Goes et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 最適化 ,  相似解 ,  データベース ,  *rRNA ,  寄生虫 ,  多重化 ,  風土病 ,  *Leishmania ,  バイオマーカー ,  病因 ,  リポジトリ ,  種分化 ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： GenBank ,  分子標的 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 微生物感染の生理と病原性  (EG03053T) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

引用文献 (46件)：

• R. Reithinger, J.-C. Dujardin, H. Louzir, C. Pirmez, B. Alexander, S. Brooker, "Cutaneous leishmaniasis," The Lancet Infectious Diseases, vol. 7, no. 9, pp. 581-596, 2007.
• R. Lainson, J. J. Shaw, "New World leishmaniasis," Topley & Wilson's Microbiology and Microbial Infections, vol. 1, 2010.
• E. Bifeld, J. Clos, "The genetics of Leishmania virulence," Medical Microbiology and Immunology, vol. 204, no. 6, pp. 619-634, 2015.
• A. Stauch, H. P. Duerr, A. Picado, B. Ostyn, S. Sundar, S. Rijal, M. Boelaert, J. C. Dujardin, M. Eichner, "Model-based investigations of different vector-related intervention strategies to eliminate visceral Leishmaniasis on the Indian subcontinent," PLoS Neglected Tropical Diseases, vol. 8, no. 4, article e2810, 2014.
• R. C. S. de Morais, C. N. da Costa Oliveira, S. da Cunha Gonçalves de Albuquerque, L. A. M. T. Silva, R. Pessoa-e-Silva, H. L. A. da Cruz, M. E. F. de Brito, M. de Paiva Cavalcanti, "Real-time PCR for Leishmania species identification: evaluation and comparison with classical techniques," Experimental Parasitology, vol. 165, pp. 43-50, 2016.

タイトルに関連する用語 (5件)： rRNA ,  解析 ,  Leishmania ,  特性化 ,  適用性