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J-GLOBAL ID：202002285506476067   整理番号：20A2451501

HpaII消化ライブラリーのNGS分析による特異的メチル化HpaII部位の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of differentially methylated HpaII sites by NGS analysis of HpaII-digested libraries

著者 (7件)： Tanaka Shinji (GeneTech, Inc., 2-6-7 Kazusa-kamatari, Kisarazu, Chiba, Japan) ,  Hayakawa Yosuke (GeneTech, Inc., 2-6-7 Kazusa-kamatari, Kisarazu, Chiba, Japan) ,  Kawashima Akihiro (Department of Obstetrics and Gynecology, Showa University School of Medicine, 1-5-8 Hatanodai, Shinagawa-ku, Tokyo, Japan) ,  Goto Minako (Department of Obstetrics and Gynecology, Showa University School of Medicine, 1-5-8 Hatanodai, Shinagawa-ku, Tokyo, Japan) ,  Matusoka Ryu (Department of Obstetrics and Gynecology, Showa University School of Medicine, 1-5-8 Hatanodai, Shinagawa-ku, Tokyo, Japan) ,  Sekizawa Akihiko (Department of Obstetrics and Gynecology, Showa University School of Medicine, 1-5-8 Hatanodai, Shinagawa-ku, Tokyo, Japan) ,  Gotoh Koshichi (GeneTech, Inc., 2-6-7 Kazusa-kamatari, Kisarazu, Chiba, Japan)
資料名： Analytical Biochemistry  (Analytical Biochemistry)
巻： 609  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： H0177B  ISSN： 0003-2697  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 差次的メチル化領域(DMRs)はエピジェネティックバイオマーカーとして広く研究されている。ここでは,メチル化感受性制限酵素(MSRE)と次世代配列決定(NGS)を組み合わせた新規アプローチを開発し,絨毛(CV)と母性血液細胞(MBC)の間のDMRsを同定した。NGSライブラリー調製の間,CVとMBCのアダプタ結紮ゲノムDNAを,MSRE,HpaII,およびPCR増幅で消化した。非メチル化HpaII部位が切断されたので,得られたライブラリーはメチル化HpaII部位のみを含むはずである。HpaII消化CVとMBCライブラリーの配列決定により,CVの50%以上のメチル化増加を示す染色体21上の9つの特異的メチル化-HpaII部位を同定した。これらのDMRは,CVとMBCの差を tすためのエピジェネティックなバイオマーカーである。本アプローチは種々の組織特異的エピジェネティックバイオマーカーのスクリーニングにも適用可能である。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *メチル化 ,  感受性 ,  血球 ,  *消化 ,  絨毛 ,  結紮術 ,  アダプタ ,  DNA制限酵素 ,  PCR法 ,  バイオマーカー ,  エピジェネティクス ,  染色体21 ,  ゲノムDNA ,  母体血 ,  次世代シークエンシング

著者キーワード (5件)： 特異的メチル化領域 ,  HpaII ,  次世代シークエンシング ,  絨毛性絨毛 ,  母体血液細胞

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： HpaII ,  消化 ,  ライブラリー ,  分析 ,  メチル化 ,  同定