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J-GLOBAL ID：202002285630510810   整理番号：20A1729870

微生物群集レベルの生理プロファイル:全体のデータセットと色発達の統合動力学の考察【JST・京大機械翻訳】

Microbial community-level physiological profiles: Considering whole data set and integrating dynamics of colour development

著者 (3件)： Perujo N. (GRECO-Institute of Aquatic Ecology, University of Girona, Spain) ,  Romani A.M. (GRECO-Institute of Aquatic Ecology, University of Girona, Spain) ,  Martin-Fernandez J.A. (Dept. Computer Science, Applied Mathematics and Statistics, University of Girona, Spain)
資料名： Ecological Indicators  (Ecological Indicators)
巻： 117  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： A1221A  ISSN： 1470-160X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 群集レベル生理学的プロファイル(CLPPs)は,微生物群落の生理学的および代謝的可能性を決定するので,長い前から生態学的指標として使用され,それらの代謝を人為的ストレッサーに順応するか,または環境条件の変化に適応する能力を示す。また,これらのプロフィールは,通常生態系機能にリンクする微生物群集の機能的多様性または機能的形質の代理である。しかし,CLPPsの統計的データ解析は,これらの研究における主要なハンドカップであることが判明した。特に,接種密度の干渉,最適培養時間の選択の必要性,およびインキュベーション時間点に依存して得られた異なるプロフィールは,その有用性を制限する。この目的のために,全データセットと培養期間に沿った色発生の動力学を考慮したCLPPデータ解析のための新しい方法を開発した。このアプローチは組成データ(CoDa)変換に基づき,絶対情報よりも相対的に反映し,続いて正準変量プロットにおける分散とデータ表現の反復測定多変量解析を行った。このアプローチを,季節性,流動応力および異なる堆積物深さ条件によって影響を受ける実際の河川生物膜試料からのCLPPsを用いて試験し,今日(固定点または曲線統合,次いで主成分分析)まで最も古典的な適用手法と比較した。結果は,提案されたアプローチ(i)がCLPPsの生態学的解釈をより敏感にし,(ii)顕著な季節性の状況でさえCLPPs間の差異を明らかにし,一方,古典的アプローチが交絡結果を与え,(iii)生態学的に意味のある結果(すなわち,提案されたアプローチが,流れ条件と深さの間の有機物使用能力における有意差を示す)と(iv)CLPPsデータのための分析方法論を統一することを強調するものであることを浮き彫りにしている。”ことを強調する。”結論”。”結論],(iii)は,生態学的に意味のある結果をもたらした(i.e.提案したアプローチが,流れ条件および深さの間の有機物使用能力における有意差を示す)。また,(iv)CLPPsデータに対する分析方法論を統一する,という事を浮き彫りにした。本研究では,将来の研究で用いるR-スクリプトを提供した。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 流れ応力 ,  多変量解析 ,  河川 ,  堆積物 ,  データ表現 ,  データ解析 ,  ミクロフローラ ,  *生態学 ,  生物膜 ,  主成分分析 ,  インキュベート
準シソーラス用語： 環境条件 ,  ストレッサー ,  スクリプト ,  *微生物コンソーシアム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Biologエコプレート ,  炭素基板 ,  機能的多様性 ,  対数比 ,  代謝フィンガープリント ,  微生物群集代謝機能

分類 (2件)： 代謝と栄養  (EG03054K) ,  微生物に対する影響  (EE05020V)

タイトルに関連する用語 (8件)： 微生物群集 ,  生理 ,  プロファイル ,  データセット ,  色 ,  発達 ,  統合 ,  動力学