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J-GLOBAL ID:202002286052989167   整理番号:20A1135314

PICRUSt遺伝子機能の予測と分析に基づき,PICRUSt遺伝子多様性とPICRUSt遺伝子機能を予測した。【JST・京大機械翻訳】

Study on bacterial diversity of Mangjiao in Zunyi region and PICRUSt-based predicted metagenomic analysis
著者 (6件):
資料名:
巻: 46  号:ページ: 106-112  発行年: 2020年 
JST資料番号: C2153A  ISSN: 0253-990X  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: 中国 (CHN)  言語: 中国語 (ZH)
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本研究では、伝統培養とIlluminaMiSeqハイスループットシークエンシング技術を用いて、シキョウサンプル中の細菌多様性を分析した。結果、17株の分離菌はすべて乳酸菌であり、16株は乳酸桿菌であった。門レベルでは、Firmicutes(硬壁菌門)とProteobacte-ria(変形菌門)は絶対優勢菌門であり、累積率は99.39%であった。属レベルでは,優勢菌属はLactobacillus(乳酸桿菌属,41.37%),Pseudomonas(Pseudomonas属,16.64%),Weissella(フェルス菌属,14.96%)であった。Enterobacter(エンテロバクター属,5.04%),Pedioccus(球菌属,2.48%),Klebsiella(桿菌属,2.40%)およびBacillus(桿菌属,1.33%)であった。また、MG-RASTデータから湖北省の当陽地区の広椒の配列データをダウンロードし、さらに、シキョウとオオサンショウの細菌多様性を分析した。遺伝子機能と表現型の結果により、コショウ中の細菌は生長繁殖などの方面において著しく低いが、グラム陰性菌と病原性潜在力の相対強度において著しく高いことが分かった。相関検定により、優勢細菌属は炭水化物代謝、核酸代謝及びタンパク質代謝などに著しい影響を与えることが分かった。本研究により、本研究は後続乳酸菌の遺伝的多様性研究と産業化推進に積極的な意義を持つことが分かった。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】
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微生物学(ウイルス以外)一般 
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