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J-GLOBAL ID：202002286341280857   整理番号：20A0976820

ApoE2は死後のAD脳のトランスクリプトームおよびリピドミクスプロファイルにおける差異を調整する【JST・京大機械翻訳】

APOE2 orchestrated differences in transcriptomic and lipidomic profiles of postmortem AD brain

著者 (11件)： Lefterov Iliya (Department of Environmental and Occupational Health, University of Pittsburgh, Pittsburgh, USA) ,  Wolfe Cody M. (Department of Environmental and Occupational Health, University of Pittsburgh, Pittsburgh, USA) ,  Fitz Nicholas F. (Department of Environmental and Occupational Health, University of Pittsburgh, Pittsburgh, USA) ,  Nam Kyong Nyon (Department of Environmental and Occupational Health, University of Pittsburgh, Pittsburgh, USA) ,  Letronne Florent (Department of Environmental and Occupational Health, University of Pittsburgh, Pittsburgh, USA) ,  Biedrzycki Richard J. (Department of Environmental and Occupational Health, University of Pittsburgh, Pittsburgh, USA) ,  Kofler Julia (Department of Pathology, University of Pittsburgh School of Medicine, Pittsburgh, USA) ,  Han Xianlin (Department of Medicine & Biochemistry, Barshop Institute for Longevity and Aging Studies, UT Health-San Antonio, San Antonio, USA) ,  Wang Jianing (Department of Medicine & Biochemistry, Barshop Institute for Longevity and Aging Studies, UT Health-San Antonio, San Antonio, USA) ,  Schug Jonathan (Department of Genetics, Functional Genomics Core, University of Pennsylvania, Philadelphia, USA) ,  Koldamova Radosveta (Department of Environmental and Occupational Health, University of Pittsburgh, Pittsburgh, USA)
資料名： Alzheimer’s Research & Therapy (Web)  (Alzheimer's Research & Therapy (Web))
巻： 11  号： 1  ページ： 1-16  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7297A  ISSN： 1758-9193  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 高度な配列決定技術と改良された質量分析プラットフォームの応用は,アルツハイマー病(AD)脳における遺伝子発現と脂質の有意な変化を明らかにした。これまでの結果は,「マルチオミクス」アプローチを用いたさらなる研究を促している。これらのアプローチは,ADの主要な遺伝的危険因子としてのAPOEε4対立遺伝子の遺伝,APOEε2対立遺伝子の疾患保護効果,および脳脂質代謝におけるAPOEの主要な役割を考慮して,特に関連する。APOEε2/c(APOEε2/キャリア),APOEε3/3,およびAPOEε4/c(APOEε4/キャリア),年齢および性別マッチとして遺伝子型を決定した下壁小葉からの死後脳試料を用いて,トランスクリプトームおよび脂質におけるAPOE対立遺伝子関連変化を明らかにした。異なる遺伝子発現と共発現ネットワーク分析を適用して,アップレギュレーションとダウンレギュレーション遺伝子オントロジー(GO)用語とリピドミクスデータへの相関の経路を同定した。APOEε2/cデータセットのAPOEε3/3およびAPOEε4/c脳サンプルとの比較に基づいて,有意に影響されたGO項および経路を決定した。高度に相関したネットワークモジュールと特異的に発現した遺伝子のリストの分析は,ミトコンドリア機能,電子輸送,ATP合成と同様に,蛋白質凝集体とオルガネラの細胞内プロテアソームとリソソーム分解,ERストレス,および非折畳み蛋白質への応答に関与するGO用語の有意な濃縮を示した。mRNAの転写後修飾に重要な小核小体RNAコード化ユニット,従って翻訳及び蛋白質合成はAPOEε2/c脳試料においてAPOEε3/3及びAPOEε4/cと比較してアップレギュレーションされた。lipidomicsデータセットの分析は,10の主要な脂質クラス(排他的にAPOEε4/cサンプルの減少),最も顕著な非二層形成ホスファチジルエタノールアミンおよびホスファチジン酸,ならびにミトコンドリア膜形成脂質における有意な変化を明らかにした。本研究の結果は,ADの進行段階にもかかわらず,死後脳トランスクリプトームと脂質における有意差を指摘し,APOE対立遺伝子が病原性機構における差異を関連させることを示唆した。lipidomesとトランスクリプトームの間の相関は,プロテアソーム系とオートファジー-正準および選択的変化の協調効果を示し,細胞内分解,ERへの蛋白質侵入,ERストレスへの応答,mRNAの核小体修飾,およびAPOEε2/c脳におけるミエリン化を示す。ADの初期段階における蛋白質停滞の分子機構の更なる研究とより良い知識は,より効果的な診断アプローチと最終的に効果的な治療戦略を開発するために必要である。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 質量分析 ,  ネットワーク ,  mRNA ,  遺伝子型 ,  ヒト ,  脂質代謝 ,  対立遺伝子 ,  遺伝子発現 ,  Alzheimer病 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  プロテアソーム ,  *トランスクリプトーム ,  アポE
準シソーラス用語： 分子機構 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： アルツハイマー病 ,  ヒト脳 ,  APOE ,  RNA-seqトランスクリプトーム ,  ショットガンリピドミクス ,  マルチオミクス解析 ,  細胞内ホメオスタシスと蛋白質

分類 (3件)： 生物学的機能  (EB03040U) ,  神経の基礎医学  (GN01020W) ,  神経系の疾患  (GN03000O)

引用文献 (83件)：

• Science.; Gene dose of apolipoprotein E type 4 allele and the risk of Alzheimer’s disease in late onset families; EH Corder, AM Saunders, WJ Strittmatter, DE Schmechel, PC Gaskell, GW Small; 261; 5123; 1993; 921-923; 10.1126/science.8346443; citation_id=CR1
• J Lipid Res; Pathogenesis of type III hyperlipoproteinemia (dysbetalipoproteinemia). Questions, quandaries, and paradoxes; RW Mahley, Y Huang, SC Rall; 40; 11; 1999; 1933-1949; citation_id=CR2
• Cardiovasc Res; HDL and cholesterol handling in the brain; C Vitali, CL Wellington, L Calabresi; 103; 3; 2014; 405-413; 10.1093/cvr/cvu148; citation_id=CR3
• Neurobiol Dis; ATP-binding cassette transporter A1: from metabolism to neurodegeneration; R Koldamova, NF Fitz, I Lefterov; 72; Pt A; 2014; 13-21; 10.1016/j.nbd.2014.05.007; citation_id=CR4
• Neuron.; The role of apolipoprotein E in Alzheimer’s disease; J Kim, JM Basak, DM Holtzman; 63; 3; 2009; 287-303; 10.1016/j.neuron.2009.06.026; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (4件)： AD ,  脳 ,  トランスクリプトーム ,  差異