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J-GLOBAL ID：202002286458913309   整理番号：20A2512064

低酸素スコアを用いた黒色腫の予後予測の特徴の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of Signatures of Prognosis Prediction for Melanoma Using a Hypoxia Score

著者 (7件)： Shou Yanhong (Department of Dermatology, Huashan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Yang Lu (Department of Dermatology, Huashan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Yang Yongsheng (Department of Dermatology, Huashan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Zhu Xiaohua (Department of Dermatology, Huashan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Li Feng (Department of Dermatology, Huashan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Xu Jinhua (Department of Dermatology, Huashan Hospital, Fudan University, Shanghai, China) ,  Xu Jinhua (Institute of Dermatology, Shanghai, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 11  ページ： 570530  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 黒色腫は,最も悪性の癌のうちの1つである。低酸素微小環境は複数の細胞経路に影響し,腫瘍進行に寄与する。本研究の目的は,低酸素と黒色腫の間の関連を調査し,低酸素関連遺伝子の予後値を同定することであった。GSVAアルゴリズムに基づいて,癌ゲノムアトラス(TCGA)から採取した遺伝子発現プロファイルを用いて,低酸素スコアを計算した。Kaplan-Meierプロットは,高低酸素スコアが黒色腫患者の劣った生存と相関することを示唆した。差次的遺伝子発現分析とWGCNAを用いて,低酸素に関連する合計337の重複遺伝子を測定した。蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークと機能的濃縮分析を行い,Lasso Cox回帰を行い,予後遺伝子シグネチャを確立した。Lasso回帰は,7つの遺伝子が最良の特徴を示したことを示した。予後予測のために,新規7遺伝子シグネチャ(ABCA12,PTK6,FERMT1,GSDMC,KRT2,CSTAおよびSPRR2Fを含む)を構築した。ROC曲線はTCGAコホートと検証コホートの両方で良好な性能を推測した。したがって,著者らの研究は,黒色腫における低酸素スコアの予後的含意を決定し,予後を予測する新しい7遺伝子シグネチャを示し,予後評価および臨床意思決定への洞察を提供する可能性がある。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  意思決定 ,  ネットワーク ,  遺伝子 ,  *酸素欠乏 ,  *予後 ,  母集団 ,  *黒色腫 ,  含意
準シソーラス用語： ROC曲線 ,  腫瘍進行 ,  蛋白質間相互作用 ,  *予後予測 ,  微小環境 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： メラノーマ ,  低酸素スコア ,  予後 ,  遺伝子署名 ,  予測モデル

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (65件)：

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• Al TameemiW.DaleT. P.Al-JumailyR. M. K.ForsythN. R. (2019). Hypoxia-modified cancer cell metabolism. Front. Cell Dev. Biol. 7:4. doi: 10.3389/fcell.2019.00004 30761299
• BrandnerJ. M.HaassN. K. (2013). Melanoma’s connections to the tumour microenvironment. Pathology 45 443-452. doi: 10.1097/PAT.0b013e328363b3bd 23851614
• BrooksJ. M.MenezesA. N.IbrahimM.ArcherL.LalN.BagnallC. J. (2019). Development and Validation of a Combined Hypoxia and Immune Prognostic Classifier for Head and Neck Cancer. Clin. Cancer Res. 25 5315-5328. doi: 10.1158/1078-0432.Ccr-18-3314 31182433
• CabralA.VoskampP.Cleton-JansenA.-M.SouthA.NizeticD.BackendorfC. (2001). Structural Organization and Regulation of the Small Proline-rich Family of Cornified Envelope Precursors Suggest a Role in Adaptive Barrier Function. J. Biol. Chem. 276 19231-19237. doi: 10.1074/jbc.M100336200 11279051

タイトルに関連する用語 (5件)： 低酸素 ,  スコア ,  黒色腫 ,  予後予測 ,  同定