カナダ,トロントにおけるカルバペネマーゼ産生腸内細菌(CPE)のゲノム疫学【JST・京大機械翻訳】

Jamal Alainna Juliette; Williams Victoria; Leis Jerome; Tijet Nathalie; Zittermann Sandra; Melano Roberto; Mataseje Laura; Mulvey Michael; McGeer Allison

文献

J-GLOBAL ID：202002286545893381 整理番号：20A2535951

カナダ,トロントにおけるカルバペネマーゼ産生腸内細菌(CPE)のゲノム疫学【JST・京大機械翻訳】

Genomic Epidemiology of Carbapenemase-Producing Enterobacterales (CPE) in Toronto, Canada

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著者 (9件)： , , , , , , , ,
資料名：
巻： 41 号： S1 ページ： s479-s480 発行年： 2020年
JST資料番号： A1617A ISSN： 0899-823X 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：短報発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

目的:全ゲノム配列決定(WGS)データが,三次医療病院(病院Z,HZ)での従来の疫学とパルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)によって決定されたように,クローン伝達の解釈を変化させるかどうかを検討した。方法:2007年から2018年までの集団ベースのサーベイランスにより同定されたすべてのカルバペネマーゼ産生Enterobacterales(CPE)コロニー化または感染患者が含まれ,これはCPE検出の前または後でHZに入院し,または/または1年間に入院した。HZは,HZで同定されたCPEに対する疫学とPFGEを用いたクローン伝達クラスターを報告し,HZで潜在的に獲得された他の病院によってHZと報告された。一塩基多型(SNP)系統発生と症例疫学を評価した。結果:全体で,85のCPEコロニー化または感染患者が含まれた:50はHZで検出し,35は別の局所病院で検出されたが,前または翌年にHZに入院した。HZは6つの伝送クラスタ(Table1)を報告した。SNP分析はクラスターB,C,EおよびFを確認した。クラスターAにおいて,SNP分析は9症例のうちの2つ(おそらくプラスミド伝達を表す)に疑問を投げかけたが,他の分離株と高度に関連する分離株(0~3SNP差)を有する2つの追加症例を同定した。1つの症例は,症例1の4か月前に同じユニットにとどまった旅行関連症例である。第2の症例は,以前に5つのクラスタAケースによって占められた部屋にとどまった。クラスターDにおいて,SNP分析は,分離株が他の分離株と高度に関連(すなわち,17~19SNP差)する1つの追加ケースを見出した。この症例は,HZの患者を共有する別の病院でクラスターDの1年前に同定された;しかし,HZに対する症例の入院は,すべてのクラスタD症例が検出され,直接の疫学的リンクは同定されなかった。結論:WGSデータは,従来の疫学的方法が見逃される伝染クラスタに属する症例を同定することができる。 F閉鎖:ison Mcは,PfizerとMerckからの制度への資金を,主要な研究者であるプロジェクトのために発表する。また,Sanofi-Pastur,Sunovion,GSK,Pfizer,およびCidaraからの相談料金を報告した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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感染症・寄生虫症一般

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