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J-GLOBAL ID：202002286718910042   整理番号：20A2262454

グラフに基づくSNN-Cliq++改良セルクラスタリング法【JST・京大機械翻訳】

SNN-Cliq++ Improved Cell Clustering Method Based on Graph

著者 (5件)： Guo Lilu (Department of Computer Science and Engineering, Yulin Normal University, Yulin, China) ,  Bu Shugui (Department of Computer and Information Engineering, Nanning Normal University, Nanning, China) ,  Gan Yongjin (Department of Physics and Telecommunications, Yulin Normal University, Yulin, China) ,  Lu Jianbo (Department of Computer and Information Engineering, Nanning Normal University, Nanning, China) ,  Zhu Xiaoshu (Department of Computer Science and Engineering, Yulin Normal University, Yulin, China)
資料名： ACM Proceedings  (ACM Proceedings)
号： AICSconf ’20  ページ： 150-155  発行年： 2020年 
JST資料番号： D0698C  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： sing-cell RNA-seqデータを用いた細胞タイピングは,精密医学,生命開発および進化,および薬物研究および開発などの基礎であり,それらのデータは,超次元,小サンプル,標識無し,および高ノイズによって特性化され,従来のクラスタリング法,例えば,貧弱な細胞タイピング性能,高い計算コスト,およびパラメータ調整の困難さに挑戦をもたらす。SNN-Cliqは,2015年に提案されたセルタイピングのための優れたクラスタリングアルゴリズムであり,単純かつ効率的な計算プロセスのユニークな特性,良好なスケーラビリティおよびパラメータの非感受性を有する。先行研究のフレームに基づいて,3つの改良を,著者らの新しい方法,すなわちSNN-Cliq++において提案した。最初に,ユークリッド距離をSpearman相関係数で置換し,各セルペア間の類似性を測定した。第2に,著者らは,最小|クラスタNum-真Num|によって制約されたパラメータkを最適化して,このプロセスが多くの時間を費やさないことに注意する。第3に,著者らは,トップネガティブスピアマン相関係数を持つセル間の禁制接続に負性を示す。広範囲なデータセットにおいて,結果は,新しいアルゴリズムが,オリジナルより顕著な改良を持ち,NMIが20.5%上昇し,ARIが平均28.6%上昇することを明らかにした。Please refer to this article’s citation page on the publisher website for specific rights information. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  最適化 ,  雑音 ,  相関係数 ,  RNA【核酸】 ,  感受性 ,  *クラスタ ,  類似性 ,  キャラクタリゼーション
準シソーラス用語： 単一細胞 ,  計算コスト ,  Euclid距離 ,  クラスタリングアルゴリズム ,  クラスタリング法 ,  RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 細胞タイピング ,  クラスタリングアルゴリズム ,  グラフモデル ,  グループ発見 ,  類似性測定 ,  単一細胞RNA-seqデータ

分類 (5件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  微生物検査法  (EG02020G) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  生化学的分析法  (EA03030G) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (3件)： グラフ ,  セル ,  クラスタリング法