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J-GLOBAL ID：202002286722768618   整理番号：20A1845736

ブタ全ゲノム範囲のETS遺伝子ファミリーメンバーの同定、進化と発現分析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide identification, evolutionary and expression analysis of the ETS transcription factor family in the pig

著者 (10件)： Wang Zhipeng (東北農業大学動物科学技術学院,哈爾浜 150030;東北農業大学生物信息中心,哈爾浜 150030;東北農業大学黒竜江省高校動物遺伝育種与繁殖重点実験室,哈爾浜 150030) ,  Zhou Meng (東北農業大学動物科学技術学院,哈爾浜 150030;東北農業大学生物信息中心,哈爾浜 150030;東北農業大学黒竜江省高校動物遺伝育種与繁殖重点実験室,哈爾浜 150030) ,  Guo Yuanyuan (東北農業大学動物科学技術学院,哈爾浜 150030;東北農業大学生物信息中心,哈爾浜 150030;東北農業大学黒竜江省高校動物遺伝育種与繁殖重点実験室,哈爾浜 150030) ,  Zhang Chaoxin (東北農業大学動物科学技術学院,哈爾浜 150030;東北農業大学生物信息中心,哈爾浜 150030;東北農業大学黒竜江省高校動物遺伝育種与繁殖重点実験室,哈爾浜 150030) ,  Wang Tao (東北農業大学動物科学技術学院,哈爾浜 150030;東北農業大学生物信息中心,哈爾浜 150030;東北農業大学黒竜江省高校動物遺伝育種与繁殖重点実験室,哈爾浜 150030) ,  Liu Shengwei (東北農業大学動物科学技術学院,哈爾浜 150030;東北農業大学生物信息中心,哈爾浜 150030;東北農業大学黒竜江省高校動物遺伝育種与繁殖重点実験室,哈爾浜 150030) ,  Yan Xiaohong (東北農業大学動物科学技術学院,哈爾浜 150030;東北農業大学生物信息中心,哈爾浜 150030;東北農業大学黒竜江省高校動物遺伝育種与繁殖重点実験室,哈爾浜 150030) ,  Ding Kun (東北農業大学生物信息中心,哈爾浜 150030;内蒙古師范大学計算机科学与技術学院,呼和浩特 010022) ,  Zhu Qiusi (東北農業大学動物科学技術学院,哈爾浜 150030;東北農業大学生物信息中心,哈爾浜 150030;東北農業大学黒竜江省高校動物遺伝育種与繁殖重点実験室,哈爾浜 150030) ,  Yang Liang (東北農業大学動物科学技術学院,哈爾浜 150030;東北農業大学生物信息中心,哈爾浜 150030;東北農業大学黒竜江省高校動物遺伝育種与繁殖重点実験室,哈爾浜 150030)
資料名： Dongbei Nongye Daxue Xuebao  (Dongbei Nongye Daxue Xuebao)
巻： 51  号： 5  ページ： 58-69  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2891A  ISSN： 1005-9369  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ETS転写因子ファミリーは動物に広く存在し、細胞分化制御、細胞周期制御、細胞死亡など多くの生物学的過程に関与する。本論文では、バイオインフォマティクス方法を用いて、ブタETSファミリーメンバーの進化関係と調節マップを分析し、RNA-Seqデータと結合して、その組織発現規則を分析した。ブタ(Susscrofa)の蛋白質配列をPfamにより同定し,ブタゲノム上で23のETSファミリー遺伝子を同定した。ETSファミリー遺伝子,蛋白質一次構造,高次構造,および細胞内局在性予測を分析した。最尤法に基づき、ETSファミリー系統発生樹を構築し、11個のサブファミリーに分けられ、サブファミリーメンバーの保存ドメイン、遺伝子構造、理化学性質が似ている。ETSファミリー,標的遺伝子およびmiRNAから成る遺伝子調節ネットワークを,生信解析により構築し,40個のETSファミリー遺伝子-miRNA-標的遺伝子”フィードフォワード回路をスクリーニングした。転写発現スペクトルにより、ETSファミリー遺伝子は成年雄豚と母豚28種類の異なる組織に発現され、ETS1遺伝子は免疫組織(リンパ、脾臓)と末梢血単核細胞で高発現しており、SPIC遺伝子は免疫組織(リンパ、脾臓)で高い発現を示した。研究結果は、ETSファミリーメンバーの生物学的機能の解明に基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 動物 ,  RNA【核酸】 ,  アミノ酸配列 ,  *遺伝子 ,  タンパク質 ,  脾臓 ,  リンパ ,  系統樹 ,  フィードフォワード ,  *ゲノム ,  細胞分化 ,  転写因子
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  バイオインフォマティクス ,  ドメイン構造 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (9件)： ブタ ,  ゲノム ,  ETS ,  遺伝子ファミリー ,  メンバー ,  同定 ,  進化 ,  発現 ,  分析