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J-GLOBAL ID：202002286764321397   整理番号：20A0009750

ヒト腫瘍抑制遺伝子のヌクレオチド組成とコドン使用パターンへの洞察【JST・京大機械翻訳】

Insights into the nucleotide composition and codon usage pattern of human tumor suppressor genes

著者 (3件)： Mazumder Tarikul Huda (Department of Biotechnology, Assam University, Silchar, Assam, India) ,  Uddin Arif (Department of Zoology, Moinul Hoque Choudhury Memorial Science College, Hailakandi, Assam, India) ,  Chakraborty Supriyo (Department of Biotechnology, Assam University, Silchar, Assam, India)
資料名： Molecular Carcinogenesis  (Molecular Carcinogenesis)
巻： 59  号： 1  ページ： 15-23  発行年： 2020年 
JST資料番号： W0229A  ISSN： 0899-1987  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 腫瘍抑制遺伝子は,細胞増殖と腫瘍発生の非制御増殖を阻害する異なる蛋白質をコードする。遺伝子発現レベルを予測するための手掛かりを得るために,遺伝子のコドン利用バイアス(CUB)を理解し,それ自身の組成特性と独特のコード配列を持つゲノムを特性化することが必須である。著者らは,以前に報告されていなかった637人のヒト腫瘍抑制遺伝子のコドン使用パターンを分析するために生物情報学的ツールを用いた。これらの遺伝子のコドンの平均有効数は48で,低いCUBを示した。著者らの結果は,異なるヌクレオチド組成の間で有意な正の相関を示し,C塩基によるコドン末端は,ヒト腫瘍抑制遺伝子において,それぞれ最も過剰発現したコドンCTGおよびGTGと共に,ロイシンおよびバリンアミノ酸をコード化する最も頻繁に使用された。中性プロットは有意な正相関(ピアソン,r=0,646;P<0.01)を示し,GCバイアスの突然変異がCUBに影響する可能性があることを示唆した。しかしながら,ヒト腫瘍抑制遺伝子におけるGC_3に対するGC_12の線形回帰係数は,自然淘汰がヒトにおける腫瘍抑制遺伝子のコドン使用パターンにおいて小さい役割を果たす一方で,自然淘汰が主要な役割を果たすことを示唆した。本研究は,CUBに影響を及ぼす因子とヒト腫瘍抑制遺伝子におけるコドン使用パターンに光を当てる。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アミノ酸 ,  細胞増殖 ,  *ヒト ,  *遺伝子 ,  順相 ,  *コドン ,  腫瘤形成 ,  自然淘汰 ,  *癌抑制遺伝子 ,  突然変異 ,  ゲノム ,  *ヌクレオチド ,  タンパク質 ,  バイアス ,  遺伝子発現

著者キーワード (4件)： コドン適応指数 ,  コドンの有効数 ,  相対的同義コドン使用 ,  癌抑制遺伝子発現

分類 (2件)： 消化器の腫よう  (GH04000D) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (6件)： ヒト ,  腫瘍抑制遺伝子 ,  ヌクレオチド ,  組成 ,  コドン ,  洞察