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J-GLOBAL ID：202002287038615452   整理番号：20A1081216

東アフリカからのサツマイモfe説モットルウイルスのゲノム解析【JST・京大機械翻訳】

Genomic analysis of Sweet potato feathery mottle virus from East Africa

著者 (12件)： Wokorach Godfrey (Biosciences Research Laboratory, Gulu University, P.O. Box 166, Gulu, Uganda) ,  Otim Geoffrey (Biosciences Research Laboratory, Gulu University, P.O. Box 166, Gulu, Uganda) ,  Otim Geoffrey (Faculty of Agriculture, Gulu University, P.O. Box 166, Gulu, Uganda) ,  Njuguna Joyce (Biosciences Eastern and Central Africa, International Livestock Research Institute (BecA-ILRI) Hub, P.O. Box 30709, Nairobi, 00100, Kenya) ,  Edema Hilary (Biosciences Research Laboratory, Gulu University, P.O. Box 166, Gulu, Uganda) ,  Njung’e Vincent (Biosciences Eastern and Central Africa, International Livestock Research Institute (BecA-ILRI) Hub, P.O. Box 30709, Nairobi, 00100, Kenya) ,  Machuka Eunice M. (Biosciences Eastern and Central Africa, International Livestock Research Institute (BecA-ILRI) Hub, P.O. Box 30709, Nairobi, 00100, Kenya) ,  Yao Nasser (Biosciences Eastern and Central Africa, International Livestock Research Institute (BecA-ILRI) Hub, P.O. Box 30709, Nairobi, 00100, Kenya) ,  Stomeo Francesca (Biosciences Eastern and Central Africa, International Livestock Research Institute (BecA-ILRI) Hub, P.O. Box 30709, Nairobi, 00100, Kenya) ,  Echodu Richard (Biosciences Research Laboratory, Gulu University, P.O. Box 166, Gulu, Uganda) ,  Echodu Richard (Faculty of Agriculture, Gulu University, P.O. Box 166, Gulu, Uganda) ,  Echodu Richard (Department of Biology, Faculty of Science, Gulu University, P.O. Box 166, Gulu, Uganda)
資料名： Physiological and Molecular Plant Pathology  (Physiological and Molecular Plant Pathology)
巻： 110  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W0836A  ISSN： 0885-5765  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： サツマイモ羽毛ウイルスはサツマイモに感染するポチウイルスである。ウイルスのゲノムを分析して,遺伝的多様性,進化,および遺伝子流動を理解した。モチーフ,ヌクレオチド同一性および系統樹を用いて,分離株の系統群を決定した。遺伝子流動と遺伝的多様性をDnaSPv5を用いて試験した。コドン進化は,Datamonkeyに埋め込まれた3つの方法を用いてテストされた。結果は,東アフリカ内の系統群Bの分離株の発生を示す。KenyaとUgandaの分離株間で低い遺伝的分化が観察され,2つの国間の遺伝子流動の証拠を示した。4つの遺伝子は,機能的モチーフの中で正に選択されたコドン境界を持つか,または起こっていることがわかった。P1遺伝子内のモチーフは系統群AとBの間で異なって進化した。遺伝子流動の証拠は,2つの国の間のウイルスの頻繁な交換を示し,P1遺伝子モチーフは,系統群の分布をマッピングするために使用できる可能性のあるマーカーを提供する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  コドン ,  *サツマイモ ,  ヌクレオチド ,  系統樹 ,  アフリカ ,  羽毛 ,  ポチウイルス
準シソーラス用語： *ゲノミクス ,  *ウイルスゲノム ,  遺伝子流動 ,  遺伝多様性 ,  分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： サツマイモ ,  ポチウイルス ,  東アフリカ ,  組換え ,  SPFMV

分類 (2件)： 菌類による植物病害  (FC04052Y) ,  微生物感染の生理と病原性  (EG03053T)

タイトルに関連する用語 (4件)： アフリカ ,  サツマイモ ,  Fe ,  ゲノム解析